Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TRAF3IP2-AS1:45

Sequence Length

1043 nt

GC Content

0.5580

AGUGUUCGGGGCCGUUUUGGCGGCUAUGCAGGAUUGGCAGGAGCUGCGAUGCUCACACUUGCCUCGCCGACCGCCAUUUCACAUCCAGCAGAGGAGGCGGGGGCAGCCGCUGAGACGGUUUUUCACAAGGUAAGAAAAUCCGCCCGCGUGAGGAGGGAGGCGAGGCGCAGAUCUCGUGCCGCUGCGGCCUCGCGGGAGGGAAGGGCGGGCGGGCGGCGGAACGGGCGGGGCCGGGUGCGGACGCAGCCGGCCCUUCUCAGGUAACGCCGCGGCUCCGCGCGUGGCCCGGGGGCGGUGCGAAGGGUGGGGGCGCGCGGGCGCGGGCUUCGGCCUAUAAAAGGGCCGCCCUGGCGUUCCCCCUUCCCGAACGUGCCGCGCGAGCCGCGGUGCCCCCUCCUCUUUGCUGCUGCAGUGUCUGCGCCGGGCCAUUUAAUGAGAUUUAUUCACGCACGGCUCUUCUCAGCUUUGCGAGGGGUUGGCAGAUCCAGUGCACAGGGAUUUCCCACUACCGUGUUUUUCUCCCGCCCCCUUCCUUCCCUCUCGUCCUAAUACAUCCUUCGUUGGUUUCCUCGGCCCCGCAGGCUGCGUCCCGGGCACGCGCAAGUACAUGUGCAUUUUAGUGGUUACCAGGUUGCCACGUAUUUGAAGUGGUGUGAGAGCUACUCGUUUGGAACCGUUGUGGAUUUUCAAAUAGGAAAAUCAAAAGGCCCAAAGAGACAGCUCACUGGUGACCAUGCUUUGGGAUUUUCAUAGUUUGAGUAAUUCCUAUGGGCUCUACCACCCAGCGAGUUAAAGAAGACAAGAUUCCACCCCCAGGGGGUUGUGGUUCUGGGAAUGUGAGCAGCUUGUUUUCAGGAGAUCUGCAUCUUGAUCUGGCCUGCUAUUAGGAUCUGUGGUGGUGGUGCCUGUCUGGUUUUAGUUGUUUCUUUUAUCUUACACAGAUUUUUGUAAGUUAUUUGCAUAUAAAGGUUUUUGAAAAGUGAAUGUUUUAUGGGGGCAUCUUGCUUAUACAAAGAAAAAUUAAAACUGUUUUAAAAUAAUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-438.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -453.22

Frequency: 0.0000

Diversity: 193.48

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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