Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TRAF3IP2-AS1:48
Sequence Length
561 nt
GC Content
0.5152
AGUGUUCGGGGCCGUUUUGGCGGCUAUGCAGGAUUGGCAGGAGCUGCGAUGCUCACACUUGCCUCGCCGACCGCCAUUUCACAUCCAGCAGAGGAGGCGGGGGCAGCCGCUGAGACGGUUUUUCACAAGGAAAUGACCUCAUUCUUGAUGGCUGCUGCUAACUUAUGGUGAGAUGCUGGGUCCCUGCCCAAUACCACAUGGACAUCCAAUCAAUUUACCCAGGGACAAGUCCACUCAAGAGCAUCAUUUAGAAGAGGGAAAAGGCACUGGGGUUAUUUGUUUUUGGAGUAUGUGCUUAAGGAAAUCUAGAGUAUUCCCACGAGCAUUCUGCUGAGAUGAACAAUCAGAUGACCUCGUGUGAGAUUUGGAGGAGAGAAGGAAAUGGAGAGCAUGCGUCUGCCGCUUCUGUGGUUUCUGUCGCAACCUUCGUGGGACUCAUUGCUGCUGGAGGCCUCAUAAAUAUUCUAGGGCUACAAUGCCCUGCAAAAAACCCAUCAGCACUGGCAACCCUGACCCUCUUCUCUGUGGUUAGAUGGGAGCCAGGGCCAAGGGACAUGCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-187.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -197.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.((((((..(((((((((...((((((.(((((((.((....((((((.((.((.((((.((..(((..(((((((((((((((...(((..((.((((((((.(((((.((((((((.....)))).))))....))))).)))))))).))..))).........))))))(((((((............(((....)))...........)))))))...(((.(((.................)))))).........((((((((((((((....((((.((((((..((((..........))))...))))))..)))).....)))))....)))))))))))))))))).))).)).)))..).)).))..)))))))).))))))).)))))).......(((.((.......)).))).....)))))))))))))))...)))))...(((((......)))))(((.....(((....((.(((((..(((((((((........).))))))..))..))))).))...)))...)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.((((((..(((((((((.,{((((((.(((((((,((.{{,((((((.((.{{.((((.{{..((.(((,,((,((((((((({{.(((..((.((((((((.{((((.((((((((.....)))}.))))....))))).)))))))).))..)))..,{{{.,,||,||{((,,,,|}}}}.,.,},..{{{...,))}.........{{|||||||..,({{.(((.,,.,,....,,,....))))))....,}.}}|||||,||||||||}|}}{|||.((((((..(({{..|....}.,)))),..))))))}}))))}.))}).....{{{,|||,,,,))),)))))..))).)).).),,)),,.))..)))))))),)))))}),)))))).}.},},{{{.{,.{,...,}),)}}.,,,.))))))))}))))))...}}}}},..(((((......))))){{{.....(((....((.(((((..(((((((((........).))))))..))..))))).))...)))...)))...
Back