Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TRAF3IP2-AS1:55
Sequence Length
1095 nt
GC Content
0.4849
CCCGAACGUGCCGCGCGAGCCGCGGUGCCCCCUCCUCUUUGCUGCUGCAGUGUCUGCGCCGGGCCAUUUAAUGAGAUUUAUUCACGCACGGCUCUUCUCAGCUUUGCGAGGGGUUGGCAGAUCCAGUGCACAGGGAUUUCCCACUACCGUGUUUUUCUCCCGCCCCCUUCCUUCCCUCUCGUCCUAAUACAUCCUUCGUUGGUUUCCUCGGCCCCGCAGGCUGCGUCCCGGGCACGCGCAAGUACAUGUAAGGACUUGUCAGCUGCCGGUGACCUCCCUCCUCCCUCGUCGCUCCUCCCCCAGCGGAAUGUAGGAUUAACAGUCUUUCCGAGAAAAUUUUGGCCAAAGAAAAAGGCCUGUGAAAGUCACCGCGUUAGACGUGGCCUCCUCGUGUUUUUCACUAACACGUUAUGGAAGGUUUUACUACCCGAAGGCAUAAAAGCACCACCGUGGGGAAGGGCCGUUUUGAAUAAACAACUUUAUUCAAAAAUCGAGAGGGGGUGAAGCGAUGCAGUUAGGGAAUUUUUGUUUUAAAGAGUAGUAACAUGCAGCUGGCUUGGCUAUUAAAUUGGAAACAAGGGGUUCCUCUCUGACUUGGCCACUGAUAUUGGGCGUGACCUUGGACAAAUAAUUUUGUUUCUUUGGGCUCAGUUUCUACAUAUGUAAAACGGGAAGGUUUCUCUUAAAAACUAAUCCUGAAGGGUUUCUUCUCAACAAAAAGAUGCAAGCUGUAGGAGGCAGAAAGCGUGGGUUCAAGUUCGAAAUUUGCCCCUGAAUUAGGACCCUUGACACAUUUCUAACCCAUCCAAGUAGAGAUCGUUCUUUUACAUUUGUGUGUUAUACAGGUGCAUUUUAGUGGUUACCAGGUUGCCACGUAUUUGAAGUGGUGUGAGAGCUACUCGUUUGGAACCGUUGUGGAUUUUCAAAUAGGAAAAUCAAAAGGCCCAAAGAGACAGCUCACUGAACUGGUGUCCAUAGAAGACGAGAUUAGAACACAGACGUGUCCACACAGAGGAGAGACCAUGUGAGGACAGAAGGAGAAGACAGCCUCAGGAUGAAAUGAACCCUGCUGAAACCUUGAUCUUGGACUUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-329 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -351.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 256.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((((((((.....))))))))............((((((((((((((((((..(((((.....((((((........((((.((((......)))).))))(((((.(((.(((......((((.((............))))))...))).))).)))))........))))))..........((......)).......))))))))))))...(((((((.((.((((((((.(......).))))))..)))))))).))).(((((.....(((((((((.(.(((((..(((((....(((((...))))))))))..........((((.........))))...........((((((...))))))((....((((((.......))))))....))..(((......)))....(((.......(((....))).......))).(((((((((((....))))))))))).......))))).).))))))).))..)))))((((((......))))))....)).)))))).))).((((((.......(((..(....)..))).........))))))..((.(((((((.(((....(((((((....)))))))..))).))))))).))(((....)))...))))((((((((............(((((((.((.(.(((((((......((((((((..((((((((((.((((((.((((((((.((((((...........)))))).))))))...)).).)))))...)).)))....(((((....))))).((((....))))..))))).)))))))).((((.((((((...(((((.........)))))....(((((.(((.(((((..((......(((((((......)))))))....)).))))))))..)))))......)))))).)))).........................(((((.((((..((.....)).)))).)))))....))))))).).)))))))))...............)))))))).....(((....))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...((((((((.....)))))))),,,,,......,((,{,,|||{{(((((((..(((((.....((((((........((((.((((......)))).)))){((((.{((.(((......((((.(({....,}}....},))))...))).))),)))}}........})))}}...,,.....{,...,.,)).......)))))))))))).|,((((({((((.((((((({.(......).})))))..)))))))).))).,,,,{.,{,,{{({{((((,{,{((((.,(((,,.,.,{{{{,...,|||||||||,,,....,,,((((.........)))).|{{,...}),|(((((...)))))}(({{{.((((((.......))))))....))..||{,,,.,,,||,,..||{......}}.,..}}}})))),}))))},(((((((((({....}))))))))))...},}}))))).}.}||}|,|{||..|||||,((((({{{{{.}},|||{{{.,|,,||,,,.,)).||||||}|.....{|||}|,}},}.)))),..})).,.)}))}}..((.(((((((.(({....(((((((....)))))))..})).))))))).))(((....)))...))))((((((((............(((((({,((.(.(((((((......{(((((({..(((((,((,({({((({,({((((((.((((((...........}))))).))))))..||}.|,|||||..,,,.,,,..|||||||,.,,))}},,}}.|}}.}}}.},.))))).))))))}}.((((.((((((..,(((((.........))))),.,.(((((.(((.(((((..((.,,...(((((((......)))))))..,.)).))))))))..))))).,....)))))).))))......,..........,.,....,{((((.((((..({.....)}.)))).))))}....))))))).).)))))))))...............))))))))....,(((....))),
Back