Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TRAF3IP2-AS1:57
Sequence Length
4782 nt
GC Content
0.4164
CCCGAACGUGCCGCGCGAGCCGCGGUGCCCCCUCCUCUUUGCUGCUGCAGUGUCUGCGCCGGGCCAUUUAAUGAGAUUUAUUCACGCACGGCUCUUCUCAGCUUUGCGAGGGGUUGGCAGAUCCAGUGCACAGGGAUUUCCCACUACCGUGUUUUUCUCCCGCCCCCUUCCUUCCCUCUCGUCCUAAUACAUCCUUCGUUGGUUUCCUCGGCCCCGCAGGCUGCGUCCCGGGCACGCGCAAGUACAUGUAAGGACUUGUCAGCUGCCGGUGACCUCCCUCCUCCCUCGUCGCUCCUCCCCCAGCGGAAUGUAGGAUUAACAGUCUUUCCGAGAAAAUUUUGGCCAAAGAAAAAGGCCUGUGAAAGUCACCGCGUUAGACGUGGCCUCCUCGUGUUUUUCACUAACACGUUAUGGAAGGUUUUACUACCCGAAGGCAUAAAAGCACCACCGUGGGGAAGGGCCGUUUUGAAUAAACAACUUUAUUCAAAAAUCGAGAGGGGGUGAAGCGAUGCAGUUAGGGAAUUUUUGUUUUAAAGAGUAGUAACAUGCAGCUGGCUUGGCUAUUAAAUUGGAAACAAGGGGUUCCUCUCUGACUUGGCCACUGAUAUUGGGCGUGACCUUGGACAAAUAAUUUUGUUUCUUUGGGCUCAGUUUCUACAUAUGUAAAACGGGAAGGUUUCUCUUAAAAACUAAUCCUGAAGGGUUUCUUCUCAACAAAAAGAUGCAAGCUGUAGGAGGCAGAAAGCGUGGGUUCAAGUUCGAAAUUUGCCCCUGAAUUAGGACCCUUGACACAUUUCUAACCCAUCCAAGUAGAGAUCGUUCUUUUACAUUUGUGUGUUAUACAGGUGCAUUUUAGUGGUUACCAGGUUGCCACGUAUUUGAAGUGGUGUGAGAGCUACUCGUUUGGAACCGUUGUGGAUUUUCAAAUAGGAAAAUCAAAAGGCCCAAAGAGACAGCUCACUGGUGGCUAUUUCUUGCCAGGAGAUUUGAGAUAUGGUGAGAAACAAAACAGACAUGGUCCCUUCCCUUAUAAGGUUUAUAGUCUAGCAUCCUAAAAAUGUAUUUUAAUCAUAUCAAUUAACAUUUAAUCAUCUCUUCUAGUUCACUGACAUGUACUUAGCAUGUCUGCCUUUAGUAAAAGCCUACCAAGUCUCCUUUACCAAUACUGUUCAACAUCUGUUAACAUCUGCCUGUUAGCAGUUUAUAAUCUAGAACAGACAGUAGUAGCUACCAUACUUUUGUGGCAGAUACUAUAAGAUGGCUUAUUCAGUAUUCAUCCAACCCUCUUCUUGCUUACUUUUCUGUACUUUAAAAGCUGGAAAACAAACUACAGUUCUCAGACUCCUUUGCAGCUAGAUUGCUGGUGUGAGAUCAAUGGUGUGAUCAGUAAAUGUUUAACAAUGGCUAGAGAAGAGGGAAGGCCCUAAUUUGUAGCAUUGGCCAAUUCGGUUUGCUUUCUUUUUGAGGAACAGGGUCUCACGAUGUUGCCCAGGCUGGUCUUGAACUGCUAGGCUCCUCCCACCUCAACCUGCCAACUAGUUGGGACUACAUGGUACAAAUGUGUCCUCUACCAGAGUGACUUCAGUAAAUGUGGAGUUAGUUGGAAAGGAUGCUGACAAUCAGAAGUUGGCUUCAGUAUAUGACCUAGUUUCCAGCAAUCAGAUGUACCCAUUCAGGACAUGGAUGUGAGAGCGAGCAACAUGAUGCUUCAACUGCACUCAGGGAGAUAAGUAUCUUCUGACAAAUACCAUGAAGGAGGUAUCUGGUUCCUCUGGGUAGGUAGGGAGGAGUUGUGGCAUCUGUUCUAGAGUCAUAGGUGCUGACUGGCAGGCAUUGCUGGGAUGGGUUUCCACUAGAAUAGCUUUGUGAUGUGGGAUGGGUGUUCUUUGUGGUUUGGUUUUUCUUGGAUGUUGUUUCUAGCUUGGUUUAUCCAAGUCUGGUUCUCUGGCCCUCUGAGAGAUCUGUGAACUAAAUAGUAUCUUUUAAUCCCUUUUUGCUUCAACCAGCCCAGUCACAGCCAGCUACAUAAUUUGUGGAGCCCAGAGCAAAAUGAAAACAAAUUAUUUUAAUAGAGAUGAGGUCUCACUAUAUUGCCCAAGCUGGUCUCGAACUCCUGGGCUCAAGCGAUCUUCCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGAGAUAACAGGUAUGAGCCACCAUGCCCUGCGAAAUUAUUCUUUUUGAGACAGAGUGAGACUCUGUCACCCAGGCUGGGGUGCAGUGACCCAAUCUCAACUCACUGCAGUCUUGACUUCCCAGGCUCAAGCAAUCCUCCCACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGACUACAGGCGUGCACCUCUACACCCAGCUAUUUUUCAUAUUUUUUUGGAGACAGGGUUUCACUAUAUUGCCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGAGCUCAAGUGAUCUGCCUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCAUGGCGCCCAGCCUCAAGCUAAAUUAUUCUUUGUGUCAUCCCUUUUCUUUCCUUCACUUUCAGAUAACUCAGUUUUCUUAACUACUGUAGGGCAAAUGUCUGAGUCAUUUAGUUCAGUGUUCCUCAACCAGGGGUGAUUUUUGCCGCCCUAGGGGACAUUUGGCAAAAUAUCUGGAGGCAUUUUUGAUUAUCACAUCUUACAAUGCAUAGGGCAGCCCCUGCAGCGCAAAGAAUUAUCAGGUCCAAAGUGUCAAUAGUGCAGGUGUUGAAAAACCCUGGCCUAGUUUAAAGUAAAUUUGUACCCAGCCCUUCAUCCAGUCUCUUGCCUUUAUGAAACCAUGAUGGAAAAGAAACUCAUUCCCUUUCAGAGGCAUUUGGAAGGCCUAAGUAAGUACGGCAAACUUUGGAGUCAAUUGCAUCAACCAUACAAAGUCCCAAAAGGCUUUAUAUGCAGGUUUCUGCAAUUUCUCCAUAGAACCUUCCUGGGUACAAGGUAGGCACAUAAAUAUUUGUUGCCUAAAUGAAUAAUAAUAAAAUAAUUCUUGGCUAAAAGACAUAUUUUAUUUCUUUCUCUUUAAACCAAAGUCAGAUUUAUCAUGUGGUGAGAGAUGAAUUUCCUGAACAGAGAUCUCUCUAUUCAUUUUAACCAAUUAAUUUACUCAGUUACUCAGAGAAGCAAAACUUUUCUGAAACAACUUCCACUUCCAUAAGUUAGCAGUAAUAGUCUUAAGGAAGGAAUUGAUAGCCUAUAAAUUAAAGAUGAUGUUUGAGGAACAAGAAAUAAAAGAAACUUUCAGAAUAGAGUAAUAUUAGAACUGAUGCCUGAGCUUUCCAGGACCCUCAUUUAAAUUACAUAUCCAGAAUUGAUAUUGGAGCAUUUCCAAUGGAUUAUAUUAUAGAUAGGCAGGAGGAGACCAAACACACAUAGAGUAAGGAUAGAUAAAAUUCCCAAUUUAAAUAAUUAAGAUGCAAAAUCUCAGAAGCUAGGUAUCUAUUUGGAUCAACAUAUCUCAGGGUAGUUUCCCCUGGCCCCAAAGUUUAUUGCAUUUUAAUAUUCACAGUGUAAAUCACAUUCCAGAAAAACUCCCACUAAAAAGCUUUUUACUGAGACUGGGCAGGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGUACUUUGGAAGACCAAGGUGAGAUUAUUGCUUGAGCCCAGAAGUUUGAGACCAGCUUGGGCAACAUAGUGAGACCUUGUCGCUACAAAAAAUUAACAAUUAGCCAGGCGUGGUGAUGUAUGCCUGUAGUCCCACUUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCACUGGAGCCUAGGAAGUUGAAGCUGCAGUGAGCCAUGAUCACCACUGCACUCCAGCCUGGGUCACAGAGCAAGACCCUGUCUCAAAAAACACACACACAGAAAACUUUGUUAUUGACACUGGAUUCUCCUAGAUUUUGCUUUAUUUUACAUCCUCAUUCCAGAGGCCAGAAAAGACUACUUAUUCUCAGAUGUGUAAAUAUAGAUAAGUCCUUCUGUUUCUUCAUUUUCUCAAUAAAAUGUAUUUUUCCAAUUUUAAAAGUUUUUAAAUGCAUAGCAUGGAAAACAUGGAGGACAAUAAAGAAAAAUAUAGAACAUUCAGUCUCACCCAGUGGAAGUCAUGAUUAACAUUCUAGUCCAUUCUGUUUCUAGAAAAUUUUUCUGUAAAUAUAUUACAUAGAGAAAAUAAUGUCCUAGUUUUUUCACUUUGCAUCAUAACAAGCAUUUUCCAUGUAAAUUAAAACUCUUCAUAUACAUUGUUUUAAUGGCUGCAAAAUAUGCUGUGUUGUGGACAUAUGAUAAUUUACCUAACCAUUUUCCCACUGUUGGCCAACAACAGAAUGGUUCAAAUUUUACAUUAUCUUGUAUAUCACACUGAGCAUUUUUAGGCUGAAAAUUUUGCUCCAUUUUGGAUCCUAUCCUGAAUUUUUCAAGGAACUUACUUUCUAGUUCACUAUUUGAUAUCACCAGUUCUUGGUACAUACCAUGUUCUUUCUACACAGAAGAGAGAAUUGCAUGUGAUACUCAUUCUGCCUGGUUUGCUCUUCCUUUCCCUGUCUCUUUUUGCCAAGUUAACCCACUCUUUUCUUUCUUAAAGAUUUCAGUAAGUAGGAGUAGAGACCUUCCUGUGUCAGUACUUAGUCAAAAUAUAAAAUUGGAAUAGGAAGAAGAUUUUUUAAUAGAGGUUUUUUUGUUGUUUGCUUUUUUUACUUGAAGUUCCGGGAUACAUGUGCAGAAUGUGCAGGUUUGUUACUUAGGUAUACAUGUGCCAUGGUGGUUUGCUGCACCUAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1532.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1616.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 965.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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