Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TRAF3IP2-AS1:6

Sequence Length

2191 nt

GC Content

0.4240

CGAGGGGCUUGCGGGAGGGGGGCGCCAGUGUUCGGGGCCGUUUUGGCGGCUAUGCAGGAUUGGCAGGAGCUGCGAUGCUCACACUUGCCUCGCCGACCGCCAUUUCACAUCCAGCAGAGGAGGCGGGGGCAGCCGCUGAGACGGUUUUUCACAAGAAAUUAUUUUAAUAGAGAUGAGGUCUCACUAUAUUGCCCAAGCUGGUCUCGAACUCCUGGGCUCAAGCGAUCUUCCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGAGAUAACAGGUAUGAGCCACCAUGCCCUGCGAAAUUAUUCUUUUUGAGACAGAGUGAGACUCUGUCACCCAGGCUGGGGUGCAGUGACCCAAUCUCAACUCACUGCAGUCUUGACUUCCCAGGCUCAAGCAAUCCUCCCACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGACUACAGGCGUGCACCUCUACACCCAGCUAUUUUUCAUAUUUUUUUGGAGACAGGGUUUCACUAUAUUGCCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGAGCUCAAGUGAUCUGCCUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCAUGGCGCCCAGCCUCAAGCUAAAUUAUUCUUUGUGUCAUCCCUUUUCUUUCCUUCACUUUCAGAUAACUCAGUUUUCUUAACUACUGUAGGGCAAAUGUCUGAGUCAUUUAGUUCAGUGUUCCUCAACCAGGGGUGAUUUUUGCCGCCCUAGGGGACAUUUGGCAAAAUAUCUGGAGGCAUUUUUGAUUAUCACAUCUUACAAUGCAUAGGGCAGCCCCUGCAGCGCAAAGAAUUAUCAGGUCCAAAGUGUCAAUAGUGCAGGUGUUGAAAAACCCUGGCCUAGUUUAAAGUAAAUUUGUACCCAGCCCUUCAUCCAGUCUCUUGCCUUUAUGAAACCAUGAUGGAAAAGAAACUCAUUCCCUUUCAGAGGCAUUUGGAAGGCCUAAGUAAGUACGGCAAACUUUGGAGUCAAUUGCAUCAACCAUACAAAGUCCCAAAAGGCUUUAUAUGCAGGUUUCUGCAAUUUCUCCAUAGAACCUUCCUGGGUACAAGGUAGGCACAUAAAUAUUUGUUGCCUAAAUGAAUAAUAAUAAAAUAAUUCUUGGCUAAAAGACAUAUUUUAUUUCUUUCUCUUUAAACCAAAGUCAGAUUUAUCAUGUGGUGAGAGAUGAAUUUCCUGAACAGAGAUCUCUCUAUUCAUUUUAACCAAUUAAUUUACUCAGUUACUCAGAGAAGCAAAACUUUUCUGAAACAACUUCCACUUCCAUAAGUUAGCAGUAAUAGUCUUAAGGAAGGAAUUGAUAGCCUAUAAAUUAAAGAUGAUGUUUGAGGAACAAGAAAUAAAAGAAACUUUCAGAAUAGAGUAAUAUUAGAACUGAUGCCUGAGCUUUCCAGGACCCUCAUUUAAAUUACAUAUCCAGAAUUGAUAUUGGAGCAUUUCCAAUGGAUUAUAUUAUAGAUAGGCAGGAGGAGACCAAACACACAUAGAGUAAGGAUAGAUAAAAUUCCCAAUUUAAAUAAUUAAGAUGCAAAAUCUCAGAAGCUAGGUAUCUAUUUGGAUCAACAUAUCUCAGGGUAGUUUCCCCUGGCCCCAAAGUUUAUUGCAUUUUAAUAUUCACAGUGUAAAUCACAUUCCAGAAAAACUCCCACUAAAAAGCUUUUUACUGAGACUGGGCAGGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGUACUUUGGAAGACCAAGGUGAGAUUAUUGCUUGAGCCCAGAAGUUUGAGACCAGCUUGGGCAACAUAGUGAGACCUUGUCGCUACAAAAAAUUAACAAUUAGCCAGGCGUGGUGAUGUAUGCCUGUAGUCCCACUUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCACUGGAGCCUAGGAAGUUGAAGCUGCAGUGAGCCAUGAUCACCACUGCACUCCAGCCUGGGUCACAGAGCAAGACCCUGUCUCAAAAAACACACACACAGAAAACUUUGUUAUUGACACUGGAUUCUCCUAGAUUUUGCUUUAUUUUACAUCCUCAUUCCAGAGGCCAGAAAAGACUACUUAUUCUCAGAUGUGUAAAUAUAGAUAAGUCCUUCUGUUUCUUCAUUUUCUCAAUAAAAUGUAUUUUUCCAAUUUUAAAAGUUUUUAAAUGCAUAGCAUGGAAAACAUGGAGGACAAUAAAGAAAAAUAUAGAACAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-819 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -849.08

Frequency: 0.0000

Diversity: 338.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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