Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TRAF3IP2-AS1:8
Sequence Length
1106 nt
GC Content
0.4132
UUCGGGGCCGUUUUGGCGGCUAUGCAGGAUUGGCAGGAGCUGCGAUGCUCACACUUGCCUCGCCGACCGCCAUUUCACAUCCAGCAGAGGAGGCGGGGGCAGCCGCUGAGACGGUUUUUCACAAGGAAAUGACCUCAUUCUUGAUGGCUGCUGCUAACUUAUGGUGAGAUGCUGGGUCCCUGCCCAAUACCACAUGGACAUCCAAUCAAUUUACCCAGGGACAAGUCCACUCAAGAGCAUCAUUUAGAAGAGGGAAAAGGCACUGGGGUUAUUUGUUUUUGGAGUAUGUGCUUAAGGAAAUCUAGAGUAUUCCCACGAGCAUUCUGCUGAGAUGAACAAUCAGAUGACCUCGUGUGAGAUUUGGAGGAGAGAAGGAAAUGGAGAGCAUGCGUCUGCCGCUUCUGUGGUUUCUGUCGGUAAGCACAGUGAUGAGGUGCUGAGUUUUCCCCAGAAGGCCUCCCAGUGUCCUAUUACCAGCUUCACAAGCGUCGAGGGCAGGGCAUGGGCAUCUAUUGUUCACCAGUGGAGAUCUAUCUGGCACAGAACCGAUCCAACCAUUGCAGUGGUCACAGCGGUGUUGGCUUUCUGAUUCUCAACCUUCCUGACCGCCAGAGGAGACAGCCUCUUUGGUGGCCCUGUUCUGUGGUAUUGUGCUAACCGGUGGUGGGACUAAAACUGUCUCUAUAAUGUUUUAUUUCUUAAAAAAAAAUUCUGAAGCAAAUGUGACAAUAUGUUAACAUUCUUAAAAUCUGGGUAGUGGGAACAUGGAUGUUGUUAUUUGUGGUGUGUUUGAAAUUGUGUCAUAUUAUAAAUUUUAAAAAAAUGUUUUGACUACAAAAUCUCUAUGUAUAUGCCCAGUUUUUGUAGAUUGUUGCUUACGCUUUUCAUAUUUUUACCCAAGGAGUAAUCAGGAAUUCUAAAAGUCUUAUGUAACAGGAUUUAAAAUAAAAUUACACAGAAUCUCAACUGUACUAUAUUUUGAAAAUAUGAAUGAUUAAGAUUAUUUUUUAUAUUUUUAUUAAUAUAGAGAAAAUAAUUUCUAUAAAAUAUGCUUUCAGCUAAUGGGGGAUCCCAUUCCAUAUUUUUUUCUUUUUCUUUUUUUUUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-317.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -339.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 297.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((((((((((((..........(((((((((......))))....)))))..(((..(((((.((((..........)))).))))).)))))))))))))))))))))..............((((.((((.(((((.((((.((......(((((.(((.....(((((((............(((....)))...........)))))))..)))))).))))))))))))).))))))))......((((.((((((((((((((....((((.((((((..((((..........))))...))))))..)))).....)))))....)))))))))))))((((...((((((((((((((.((((((((((((.....(((((....)))))..((((((((.((((((((...(((((..((((..(....(((((((((.(((..((((((.......((((...))))....)))))))))..((((((.....))))))(((((((....))).))))......((((.....(((((....))))).....))))...))))))))))..)))))))))....(((((.((((.((...(((........))).)).))))))))))))))))).)))))))).(((((.......))))).........(((((((((....((((((...(((((....(((((((...........((((((((.(((((((((.(((((((.....(((..((((((((((((.............))))))))))))..)))....))))))).))((((.........))))..))))))).))))).))))))))))....)))))....))))))....))))))))).............(((((((.......))))))).............((((........)))).(((((((.((((((((((((.(((.......))).))))))))))))..)))))))(((((....)))))......)))))))))....((((((....)))))).))).))))))))))))))...))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,{((((((((((((((((......,...(((((((((......))))...,)))))..(((..(((((.((((..........)))).))))).)))))))))))))))))))}|,{....,|||,...((((.((((.(((((.((((.{{..,,...((((.(((.....(((((((............(((....)))...........)))))))..))))))}})))))))))))).))))))))..,...{(((.(((((((((((((({{..((((.((((((..((((..,....,..))))...))))))..))))..,,.)))}}..,,)))))))))))))|,,,...((((((((((((((.((((((((((((,,...(((((....))))),,{{{{((((.(((((((({..{((({,,{({(,,{.,..{{|{{{{{{.{{({,((((((,{,,{,.(((,,,,||}}....||||||||||,|||{((,,..,||}}}}{{{({{(,{,{|,,,||||..|||}{{{{,.,..({(((,,..))))}..,..)))),,,)))))))))}..)))}})}}}.....{((((((((({{....,})))}))))))}||},}}}},.))}}))))))}.}))))}}}||||||.......)))}}.....,{,,(((((({{{....{{{(((..,(({((,.{{(((({{{..,|,|{{{{.((((((((.(((((((,,....(((((((.{({,..,((((((((,,,{{{{{{{{{,,{.,,,,,)))))))}})))}...,,,,,,,.))}}))}}},.)))))))...))))))).))))).))),)))))}..,.)}}}},,,.))))}}....}}})})))}.,}}|},,.,,..{{{{{{{.......))))))).............((((........)))).(((((((.((((((((((((.(((.......))).))))))))))))..)))))))(((({....}))))......,))))))}}....{(((((....))))))}))).)))))))))))))),,,}}},,...
Back