Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

TTTY15:1

Sequence Length

630 nt

GC Content

0.4698

UUUUUUUUUUUUUUUUUGUCAGCCGGGUUCAAUGCGCCAUAUUGAAGAGGACGGGUCUAAUAGAUCGCUGGAGACACAAUUUAACUGAACCCCGCCCGUUGUGGACUGACUUUGAUGCUCUGAGUCCCUCCCUCCUUCACGCCGCUAGCAGGCCCUGAUGUAGAUUGCCUUUGUCUUACUUGGGACGUUUACCUGAGCGCUUGGUGCUGGUGUCGGGACCGGGAGAUAGGAGUGUCUCAGGAGAGACCUGGCCGAAAACCGCGAGAAAGAAAAGUGAAGCCUAGUGAAACUGCCUUUGCAGUGACUCAAGAAAAACUCAUCACCUGGAGUCCGUGUAAGCUCGGCGACAGCCCUAGCAGCGAGGCCAAAACAGUUUGGGAAGAAAGAAAACCUAAAGUAUUUGCCGUUGGUGAUUCAAGGGAAUCAAACUUGACGUAUGGAGCCAAGAAAGCCCUUGGAAAAACUGGCCUCAUAUUUUGUGUACACAGUCCCUGUACAGGGUUUCUGACCUGUGUUCAGUCUUUACAGAAGCUGACGAGAGAUUUCCUUGUAUUUUAUGGUGGUAUGAUUGGCCUUAGAGCACUUCAGUUUUGAGAUCUCUGCUGUAUUUGUAUACAAGUAUUUUGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-179.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -191.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 152.39

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((.(((((((((((((((.((((((((.......(((((.((....((.((((((...(((((.(.((....))).)))))...))..)))))))).))))).((((....((((((((......(((((((((..((((((.((.(((((.((.(.((((((..(((..((...))..)))..)))))).).)).))))).)).)))))).))))..)))))...))))))))))))....)))))))).)......)))))))))))))).)))(((.(((.(.((((((.(((((..(((((.((.............)).)))))..)))))(((.(((....)))..)))(.((((((..(((.(.((((((...........)))))).).)))))).))).)(((.((((((((((...((((..((((((.((((......((...))......)))).)))))).........((((...))))(((((........)))))..((((.((((...)))))))))))).)))))))))).)))....)))))).).))))))((((((((......))))))))...(((...(((((((....)))))))...)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{((.(((((((((((((((.(((((((({......(((((.,,..,.((.((((((...(((((.{.((....))).)))))...)}..))})))),.))))).{(((,...((((((((..{{{.(((((((((..((((((,{(.(((((.((.(.((((((..(((..({...})..)))..)))))).).)).))))).)),}))))).))))..))))),,.))))))))))))..,.)))))))).),.....}))))))))))))).}}}(((.(((.(.((((((.(((((..(((((.((.............)).)))))..))))){{{.(((....)))..})|,.{((((({(({,.{.((((((...........)))))).).})}}}}.}}),}|{{.((((((((((...((((,.{{{{{{.{(((,,....{{,,,))......)))),))}}}}..,,|,,,,{{{{...||}|{{{((,.......)))))}.{(((.((({...))))))))}}}|.))))))))))..,,....)))))).).))))))((((((((......))))))))...{{(,..(((({{{....)))))))...))}..