Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
TTTY15:7
Sequence Length
882 nt
GC Content
0.4478
GUGCUGGUGUCGGGACCGGGAGAUAGGAGUGUCUCAGGAGAGACCUGGCCGAAAACCGCGAGAAAGAAAAGUGAAGCCUAGUGAAACUGCCUUUGCAGUGACUCAAGAAAAACUCAUCACCUGGAGUCCGUGUAAGCUCGGCGACAGCCCUAGCAGCGAGGCCAAAACAGUUUGGGAAGAAAGAAAACCUAAAGUAUUUGCCGUUGGUGAUUCAAGGGAAUCAAACUUGACGUAUGGAGCCAAGAAAGCCCUUGGAAAAACUGGCCUCAUAUUUUGUGUACACAGUCCCUGUACAGGGUUUCUGACCUGUGGAUGUGAGACUUCACAACCUGCUAAAAAUGAGCUUUCAGGACCUACCCAUAUAGGAAUAAACCAUCCUAGCCAUGAGAGAUCAGAUGAAACCUGAGACCAGAGAGACUCAUUUGUUUCAAAAUAGUUUCUCCAAAAGAUUUUAUAAAAGAAAAGGCUGGGGGGAGUGGGAUAUGAAAGGAAAAUGAAUCUUGGGGCCCCCAAAUCACUAAGCUCAAGGGAUAAGUCAAGUUAGAAACUGUUCAGGGCCAACUUACCUUGCAUUCUAUUCAAAUUCACCCCUCUGCUCACUUAGAUGCAUAUCUGAUUGUAAUCAGAAACUCAAAAGAAUGCAGCAGUUUGUCUCUCACCUAUCUAUGACCUGGAAGCCCCCUUCCCCGUUUGAGUCUUCCUGCCUUUGCUUCACUUUAUCCCUGCCUUUCUAGACUGAACCAACAUACUUCUUAGAUAUAUUGAUUGAUGUCUCAUGUCUCCCUAAAAUGUAUAAAACUAAGCUGGGCCCCAACCACCUUGGGCACAUGUCGUUAGGACUUCCUGAGACUGUGUCACAAGUUUGUGUCCACAACUUUGACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-236.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -254.8
Frequency: 0.0000
Diversity: 262.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((....(((((((((((((.(((.(((((....)))))((.((........)).)).....((((((((((..((.......((..(((((..(((((.((.............)).)))))..)))))))..(((....)))...((((.(((((..((((.....((((((..........((((((((..(((...(((..((((((((.......((((.(.......).))))....))))))))...))))))...))))))))((((((.......))))))((((((((.....((((((((((((....((((.(((((.....((((((((((...(((((((.....((......)).((((((((........((((.......)))).....((((((((.((((......))))))))))))......................)))))))))).)))))...)))).......(((...(((((...))))).)))...))))))((((.(((((...(((.(((....)))..)))..)))))))))(((((((.................(((((.....)).)))..((((((....))))))........)))))))))))).)))).))))))..)))))).....)))))))).)))))).))))..))))).))))))..))))))))))..........(((......)))...((((...((...........))...))))))).))))))))....................(((.......))).((((((((((.(((.(((((....)))))))))))))).))))...).))))...)))...)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{(((({,.(((.((((((((({.,,,||||||,,,.||||}((.((.,......)).))...,,..{(({,,,,,,,{,{..(((((....))))).,|||.,|....,,}..}}...|{{.((((.((.{((((((((....))).((((((.(((((((,,,.{.((((((...........)))))).}.,||{{(,{,|||{{((({{,{|,,,},..{{{|,|,......,{||||....,,))))),.....))))))).....{{{({,.{{{{,{{{.|,|(((((........)))))}|}||||{,,..,)))),.)))))).....)))))}.)}))))}}|.,,...{((((........))))}..(((((((.(((((,{,,...((((({...((((((((.{(((,...,,))}}))))))))........,,,.....{{{{{{(((.((({{(((((((..,.{..(((({..{({...(((((...))))).}},....({(((({((,{{.((,,{(.{({(({{{((,.{(({...,,,..))}|(((((((.................(((((.....)).)))..((((((....))))))........))))))))))))))),).,)).}}.}}))),))}}..||{{|,,,.)))))}},))))))),)))))..}...,))))))))}.}))).))))))))....,,,......,....})))))...,.}},.})))).)))))))))))))......,,......,...,,|}),,)),.,}))}),,||||||,.(((.(((((....))))))))}}||||{,{||,,{{{,...))))))}}))),
Back