Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

XIST:24

Sequence Length

750 nt

GC Content

0.3933

CAGACAUUCAUAUAGGUGAUACUGUAUUUCAGUCCUUUCUUUUGACCCCAGAAGCCCUAGACUGAGAAGAUAAAAUGGUCAGGUUGUUGGGGAAAAAAAAGUGCCAGGCUCUCUAGAGAAAAAUGUGAAGAGAUGCUCCAGGCCAAUGAGAAGAAUUAGACAAGAAAUACACAGAUGUGCCAGACUUCUGAGAAGCACCUGCCAGCAACAGCUUCCUUCUUUGAGCUUAGUCCAUCCCUCAUGAAAAAUGACUGACCACUGCUGGGCAGCAGGAGGGAUGAUGACCAACUAAUUCCCAAACCCCAGUCUCAUUGGUACCAGCCUUGGGGAACCACCUACACUUGAGCCACAAUUGGUUUUGAAGUGCAUUUACAAGUUUCUGGCAUCACUACCACUACUGAUUAAACAAGAAUAAGAGAACAUUUUAUCAUCAUCUGCUUUAUUCACAUAAAUGAAGUUGUGAUGAAUAAAUCUGCUUUUAUGCAGACACAAGGAAUUAAGUGGCUUCGUCAUUGUCCUUCUACCUCAAAGAUAAUUUAUUCCAAAAGCUAAGAUAAAUGGAAGACUCUUGAACUUGUGAACUGAUGUGAAAUGCAGAAUCUCUUUUGAGUCUUUGCUGUUUGGAAGAUUGAAAAAUAUUGUUCAGCAUGGGUGACCACCAGAAAGUAAUCUUAAGCCAUCUAGAUGUCACAAUUGAAACAAACUGGGGAGUUGGUUGCUAUUGUAAAAUAAAAUAUACUGUUUUGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-183.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -200.28

Frequency: 0.0000

Diversity: 156.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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