Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

XIST:25

Sequence Length

724 nt

GC Content

0.3964

GACCCCAGAAGCCCUAGACUGAGAAGAUAAAAUGGUCAGGUUGUUGGGGAAAAAAAAGUGCCAGGCUCUCUAGAGAAAAAUGUGAAGAGAUGCUCCAGGCCAAUGAGAAGAAUUAGACAAGAAAUACACAGAUGUGCCAGACUUCUGAGAAGCACCUGCCAGCAACAGCUUCCUUCUUUGAGCUUAGACACUUCAUUUUCCUAGUCCAUCCCUCAUGAAAAAUGACUGACCACUGCUGGGCAGCAGGAGGGAUGAUGACCAACUAAUUCCCAAACCCCAGUCUCAUUGGUACCAGCCUUGGGGAACCACCUACACUUGAGCCACAAUUGGUUUUGAAGUGCAUUUACAAGUUUCUGGCAUCACUACCACUACUGAUUAAACAAGAAUAAGAGAACAUUUUAUCAUCAUCUGCUUUAUUCACAUAAAUGAAGUUGUGAUGAAUAAAUCUGCUUUUAUGCAGACACAAGGAAUUAAGUGGCUUCGUCAUUGUCCUUCUACCUCAAAGAUAAUUUAUUCCAAAAGCUAAGAUAAAUGGAAGACUCUUGAACUUGUGAACUGAUGUGAAAUGCAGAAUCUCUUUUGAGUCUUUGCUGUUUGGAAGAUUGAAAAAUAUUGUUCAGCAUGGGUGACCACCAGAAAGUAAUCUUAAGCCAUCUAGAUGUCACAAUUGAAACAAACUGGGGAGUUGGUUGCUAUUGUAAAAUAAAAUAUACUGUUUUGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-173.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -189.3

Frequency: 0.0000

Diversity: 177.8

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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