Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
XIST:4
Sequence Length
6098 nt
GC Content
0.4362
CGGGGCUGGAAGCUUCCUGACUGAAGAUCUCUCUGCACUUGGGGUUCUUUCUAGAACAUUUUCUAGUCCCCCAACACCCUUUAUGGCGUAUUUCUUUAAAAAAAUCACCUAAAUUCCAUAAAAUAUUUUUUUAAAUUCUAUACUUUCUCCUAGUGUCUUCUUGACACGUCCUCCAUAUUUUUUUAAAGAAAGUAUUUGGAAUAUUUUGAGGCAAUUUUUAAUAUUUAAGGAAUUUUUCUUUGGAAUCAUUUUUGGUUGACAUCUCUGUUUUUUGUGGAUCAGUUUUUUACUCUUCCACUCUCUUUUCUAUAUUUUGCCCAUCGGGGCUGCGGAUACCUGGUUUUAUUAUUUUUUCUUUGCCCAACGGGGCCGUGGAUACCUGCCUUUUAAUUCUUUUUUAUUCGCCCAUCGGGGCCGCGGAUACCUGCUUUUUAUUUUUUUUUCCUUAGCCCAUCGGGGUAUCGGAUACCUGCUGAUUCCCUUCCCCUCUGAACCCCCAACACUCUGGCCCAUCGGGGUGACGGAUAUCUGCUUUUUAAAAAUUUUCUUUUUUUGGCCCAUCGGGGCUUCGGAUACCUGCUUUUUUUUUUUUUAUUUUUCCUUGCCCAUCGGGGCCUCGGAUACCUGCUUUAAUUUUUGUUUUUCUGGCCCAUCGGGGCCGCGGAUACCUGCUUUGAUUUUUUUUUUUCAUCGCCCAUCGGUGCUUUUUAUGGAUGAAAAAAUGUUGGUUUUGUGGGUUGUUGCACUCUCUGGAAUAUCUACACUUUUUUUUGCUGCUGAUCAUUUGGUGGUGUGUGAGUGUACCUACCGCUUUGGCAGAGAAUGACUCUGCAGUUAAGCUAAGGGCGUGUUCAGAUUGUGGAGGAAAAGUGGCCGCCAUUUUAGACUUGCCGCAUAACUCGGCUUAGGGCUAGUCGUUUGUGCUAAGUUAAACUAGGGAGGCAAGAUGGAUGAUAGCAGGUCAGGCAGAGGAAGUCAUGUGCAUUGCAUGAGCUAAACCUAUCUGAAUGAAUUGAUUUGGGGCUUGUUAGGAGCUUUGCGUGAUUGUUGUAUCGGGAGGCAGUAAGAAUCAUCUUUUAUCAGUACAAGGGACUAGUUAAAAAUGGAAGGUUAGGAAAGACUAAGGUGCAGGGCUUAAAAUGGCGAUUUUGACAUUGCGGCAUUGCUCAGCAUGGCGGGCUGUGCUUUGUUAGGUUGUCCAAAAUGGCGGAUCCAGUUCUGUCGCAGUGUUCAAGUGGCGGGAAGGCCACAUCAUGAUGGGCGAGGCUUUGUUAAGUGGUUAGCAUGGUGGUGGACAUGUGCGGUCACACAGGAAAAGAUGGCGGCUGAAGGUCUUGCCGCAGUGUAAAACAUGGCGGGCCUCUUUGUCUUUGCUGUGUGCUUUUCGUGUUGGGUUUUGCCGCAGGGACAAUAUGGCAGGCGUUGUCAUAUGUAUAUCAUGGCUUUUGUCACGUGGACAUCAUGGCGGGCUUGCCGCAUUGUUAAAGAUGGCGGGUUUUGCCGCCUAGUGCCACGCAGAGCGGGAGAAAAGGUGGGAUGGACAGUGCUGGAUUGCUGCAUAACCCAACCAAUUAGAAAUGGGGGUGGAAUUGAUCACAGCCAAUUAGAGCAGAAGAUGGAAUUAGACUGAUGACACACUGUCCAGCUACUCAGCGAAGACCUGGGUGAAUUAGCAUGGCACUUCGCAGCUGUCUUUAGCCAGUCAGGAGAAAGAAGUGGAGGGGCCACGUGUAUGUCUCCCAGUGGGCGGUACACCAGGUGUUUUCAAGGUCUUUUCAAGGACAUUUAGCCUUUCCACCUCUGUCCCCUCUUAUUUGUCCCCUCCUGUCCAGUGCUGCCUCUUGCAGUGCUGGAUAUCUGGCUGUGUGGUCUGAACCUCCCUCCAUUCCUCUGUAUUGGUGCCUCACCUAAGGCUAAGUAUACCUCCCCCCCCACCCCCCAACCCCCCCAACUCCCCACCCCCACCCCCCACCCCCCACCUCCCCACCCCCCUACCCCCCUACCCCCCUACCCCCCUCUGGUCUGCCCUGCACUGCACUGUUGCCAUGGGCAGUGCUCCAGGCCUGCUUGGUGUGGACAUGGUGGUGAGCCGUGGCAAGGACCAGAAUGGAUCACAGAUGAUCGUUGGCCAACAGGUGGCAGAAGAGGAAUUCCUGCCUUCCUCAAGAGGAACACCUACCCCUUGGCUAAUGCUGGGGAUGUCAAAAGAUCGGCCCAGCUCAGGGAGCAGUUUGCCCUACUAGCUCCUCGGACAGCUGUAAAGAAGAGUCUCUGGCUCUUUAGAAUACUGGAUCCCAUUGAAGAUACCACGCUGCAUGUGUCCUUAGUAGUCAUGUCUCCUUAGGCUCCUCUUGAUCUUCCUCAGAAGAAUAGGCUUGUUGUUUUACAGUGUUAGUGAUCCAUUCCCUUUGACGAUCCCUAGGUGGAGAUGGGGCAUGAGGAUCCUCCAGGGGAAAAGCUCACUACCACUGGGCAACAACCCUAGGUCAGGAGGUUCUGUCAAGAUACUUUCCUGGUCCCAGAUAGGAAGAUAAAGUCUCAAAAACAACCACCACACGUCAAGCUCUUCAUUGUUCCUAUCUGCCAAAUCAUUAUACUUCCUACAAGCAGUGCAGAGAGCUGAGUCUUCAGCAGGUCCAAGAAAUUUGAACACACUGAAGGAAGUCAGCCUUCCCACCUGAAGAUCAACAUGCCUGGCACUCUAGCACUUGAGGAUAGCUGAAUGAAUGUGUCUUACCCAUUUCCAUGUUUCUCUUGCUAAUUUCUUUCGUGUGUGCCUUUGCCUCAUUUUCUCUUUUUGUUCACAAGAGUGGUCUGUGUCUUGUCUUAGACAUAUCUCUCAUUUUUCAUUUUGUUGCUAUUUCUCUUUGCUCUCCUAGAUGUGGCUCUUCUUUCACGCUUUAUUUCAUGUCUCCUUUUUGGGUCACAUGCUGUGUGCUUUUUGUCCUUUUCUUGUUCUGUCUACCUCUCCUUUCUCUGCCUACCUCUCUUUUCUCUUUGUGAACUGUGAUUAUUUGUUACCCCUUCCCCUUCUCGUUCGUUUUAAAUUUCACCUUUUUUCUGAGUCUGGCCUCCUUUCUGCUGUUUCUACUUUUUAUCUCACAUUUCUCAUUUCUGCAUUUCCUUUCUGCCUCUCUUGGGCUAUUCUCUCUCUCCUCCCCUGCGUGCCUCAGCAUCUCUUGCUGUUUGUGAUUUUCUAUUUCAGUAUUAAUCUCUGUUGGCUUGUAUUUGUUCUCUGCUUCUUCCCUUUCUACUCACCUUUGAGUAUUUCAGCCUCUUCAUGAAUCUAUCUCCCUCUCUUUGAUUUCAUGUAAUCUCUCCUUAAAUAUUUCUUUGCAUAUGUGGGCAAGUGUACGUGUGUGUGUGUCAUGUGUGGCAGAGGGGCUUCCUAACCCCUGCCUGAUAGGUGCAGAACGUCGGCUAUCAGAGCAAGCAUUGUGGAGCGGUUCCUUAUGCCAGGCUGCCAUGUGAGAUGAUCCAAGACCAAAACAAGGCCCUAGACUGCAGUAAAACCCAGAACUCAAGUAGGGCAGAAGGUGGAAGGCUCAUAUGGAUAGAAGGCCCAAAGUAUAAGACAGAUGGUUUGAGACUUGAGACCCGAGGACUAAGAUGGAAAGCCCAUGUUCCAAGAUAGAUAGAAGCCUCAGGCCUGAAACCAACAAAAGCCUCAAGAGCCAAGAAAACAGAGGGUGGCCUGAAUUGGACCGAAGGCCUGAGUUGGAUGGAAGUCUCAAGGCUUGAGUUAGAAGUCUUAAGACCUGGGACAGGACACAUGGAAGGCCUAAGAACUGAGACUUGUGACACAAGGCCAACGACCUAAGAUUAGCCCAGGGUUGUAGCUGGAAGACCUACAACCCAAGGAUGGAAGGCCCCUGUCACAAAGCCUACCUAGAUGGAUAGAGGACCCAAGCGAAAAAGGUAUCUCAAGACUAACGGCCGGAAUCUGGAGGCCCAUGACCCAGAACCCAGGAAGGAUAGAAGCUUGAAGACCUGGGGAAAUCCCAAGAUGAGAACCCUAAACCCUACCUCUUUUCUAUUGUUUACACUUCUUACUCUUAGAUAUUUCCAGUUCUCCUGUUUAUCUUUAAGCCUGAUUCUUUUGAGAUGUACUUUUUGAUGUUGCCGGUUACCUUUAGAUUGACAGUAUUAUGCCUGGGCCAGUCUUGAGCCAGCUUUAAAUCACAGCUUUUACCUAUUUGUUAGGCUAUAGUGUUUUGUAAACUUCUGUUUCUAUUCACAUCUUCUCCACUUGAGAGAGACACCAAAAUCCAGUCAGUAUCUAAUCUGGCUUUUGUUAACUUCCCUCAGGAGCAGACAUUCAUAUAGGUGAUACUGUAUUUCAGUCCUUUCUUUUGACCCCAGAAGCCCUAGACUGAGAAGAUAAAAUGGUCAGGUUGUUGGGGAAAAAAAAGUGCCAGGCUCUCUAGAGAAAAAUGUGAAGAGAUGCUCCAGGCCAAUGAGAAGAAUUAGACAAGAAAUACACAGAUGUGCCAGACUUCUGAGAAGCACCUGCCAGCAACAGCUUCCUUCUUUGAGCUUAGUCCAUCCCUCAUGAAAAAUGACUGACCACUGCUGGGCAGCAGGAGGGAUGAUGACCAACUAAUUCCCAAACCCCAGUCUCAUUGGUACCAGCCUUGGGGAACCACCUACACUUGAGCCACAAUUGGUUUUGAAGUGCAUUUACAAGGUUUGUCUAUUUUCAGUUCUUUACUUUUUACAUGCUGACACAUACAUACACUGCCUAAAUAGAUCUCUUUCAGAAACAAUCCUCAGAUAACGCAUAGCAAAAUGGAGAUGGAGACAUGAUUUCUCAUGCAACAGCUUCUCUAAUUAUACCUUAGAAAUGUUCUCCUUUUUAUCAUCAAAUCUGCUCAAGAAGGGCUUUUUAUAGUAGAAUAAUAUCAGUGGAUGAAAACAGCUUAACAUUUUACCAUGCUUAAGUUUUAAGAAUAAAAUAAAAAUUGGAAAUAAUUGGCCAAAAUUGAAAGGAAAAAUUUUUU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1758.12 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1878.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 1304.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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