Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-ATP6V1C1-10:1

Sequence Length

563 nt

GC Content

0.3979

AGAGGAAGCGGUCCUGGCAGAAACUUCACAUUGAAGCAACUCUGGGAAAUUUUUCAUGACGCUGAAAACACAAAGGAUAAAAUGUUGGGAGCUGAUCCAGUCUUAGAAAGGAGAACAAUUCAUCACGUCAGAGAAAAGAUGCUCUCUCCAUGUCGUAAGUUACACAAGAAGUAUUCACGAUAGACAAGAUAUGGAAUCAAUCUGUAACCAUCAACAAAUGAAUAAAGACGCUGUGAUGUAUACACAAAAUGGAAUACUCUACAGCAGUCCAUUGUGAAAGAGAAGGAAUUCCUGUCAUUUAUCACAACAUGGGUGAAUCUAUAGGACACGAAAAAAGGCUGGGCGUGGUGGAUCACUUCUGUAAUCCUAGCACUUUGGGAGGCUGAGAAGCUCUGAGGAGUGAAUCCACAAUACAGUUCAAAGAGAGAUUUAAAUUGCUAAUUUCCCGGCACUGGAAUGUGGGGAAAGAUUGUCACAGAUUUAGCAUGAAAGCCAUGUAUUUAACAUUCCUAUGUAAUAACCCUCUCUUAAAUUGCAUUUUGGUUUGAGAAACAGCAAGAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-134.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -146.3

Frequency: 0.0000

Diversity: 146.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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