Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-BASP1-16:1

Sequence Length

943 nt

GC Content

0.3765

UUUAACUAACACAUAUUUUAUGCAUUAGAAAUUAUAUUUGGUUAUUUUUUCAGGAAGUGUAUUUUUUACAUUAUUUAAUUCCUCAGUUAAUUAAUUUUUACAUUUGGCUCUUUUCUGAUACAUUCAAGAAGAAAUAUAUAUAUUCCUCAUAGUAAAUCUUAGGCCUUGUAUUUCCAAGGUCUUACUGUGAUUUUUACCUUGAAUAAUUACUGAUAUUUCUUCAUGGUUUAAUUUUUGUGUAUUUCUGUGAAGAGCAGCCUUGGUUUUGGAUGCCAUGAAAGGUUUAUUAUAUUGCACCUACUUUAUAUUUUUAAUCAUUCAUAUUGAUUGAUAAUCUGUCCAUUGCAGAAAUGAGGAGUUUCCAAAAAGUUUAUGGAAAUAUGUAUUAUAAAAAAAACUAUGCAUAAAUUUCAACUUUUUGCACAAAAAUAAAUGUAUACUAGCUUGUUAUAACAUGUCUAAACAGGAUCCAGUUGAAGGCACUGAGAAGAAUAAGACAUCAGUUUGAAAAGAGCCUCUAUUAAAGCAACUUGAAUUAUGCUAAAAUUGAAGUAAGAACAAACAUCAAAUGUAUGGUGAAGCUUGGGUAGAAGAAUGGUAUAAUUGCUGAUGCUCUACAAAAAGUUUAUGGGGAUAAUGUCACAAAGAAAUGAGCAGUUUACGGCCAGGCAUAGUGGCUUGCACCUGUAAUCCUGGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAGGCGGAUCACGAAGUCAAGUGAUUGAGACCAGCCUUGCCAACAUAAUGAAACCCCGCCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCGGGCAUAGUGGCGGGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGCGUGAACCCGGGAGGCGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUCCCGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCGAGACUCCGUCUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-241.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -259.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 232.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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