Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-BASP1-18:1

Sequence Length

678 nt

GC Content

0.3614

AAGAAAGGAAAGGAGGAAAAAAAACCAUAAAUCUUUAUGUAAAACUAGUUGCCCAUAAGUUUUCAGUUACUGAAGUGGAUCACCUAAUCACUAUGAACUUACUUGUUUUCCAGAUAUAAGCAUUCUUUGAUCUUUCUGUGAGUGACUUAUGUACAGAAACAGCAGUUCUGCAAUGAAUUUGAGAACACAUUGCAGAAUGGAGAAAUAGUAUCUUUAUUUUACCUGAUGUUGCUGAAACCAAGCAUCCCUAUAAAUUAUGGACAGACUUAAGGUGAAGUUUGCUCUGACUCAUAAGAUGGAAAAAAAUAUAAUAAAACAGAUAAGGUGUUUUUCACGAAUGACCUCCAGUAUUACGUGGACAUACACUUGCUGGCAUGGCAGGCAUACGUAGCACAACAGGAUACAUAUCAGAGAAGUUAUUUUGGUCAUAACAACCAUUCUUUGUGCUUCUCCUACUUGUGGAAUCGUGCGGAUGAUCUCUUUCAAUUAUUAAUAAAGCCACCUUUAAGGGUUUUAUCAUCACAAAUCACAGUUUCCAGGAGGGUAAAAAUACAGCACUGCUCUAUAAUUCAGCUUAUUGAAGAUUCCUGGUAUUUAACUGAAGAGUCCAAAACAUAUGUGGUGGGAAUGAUGUCAUGCAGAAAGGUGCCCUGUUCAAUUUGGAAUGUAUCAGUAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-145.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -158.28

Frequency: 0.0000

Diversity: 185.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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