Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:114
Sequence Length
2060 nt
GC Content
0.3937
GUGAUGUCAUUGAACUCUUAAGUGCAAGAUGAAACAAGUCUUUCUGGGGUUCUAAGUAGGCAUGGUGUAAGGAACUUGAGCUCAAAAUGAACUAAGACACAGUCUUGUUCACACAGUGGAAGAGUACUGAGCUGUCUCCGAAGAAUUCAGAUUAUUGAAUGUAGGCACCCUUUUCUGAUUUCCUUCAUCAAUUCAAUUCAGGAGAUGUGAUGCAAUGUGAUGUGUCAAUGUAUGUAUGAUCGAAGUGUCAGUCUCUAUAAGUACUCCGCUCCAUGAUCCUGGGGUGAAGUGCUACAAAACACAUUUUUGGUGGAGCAGAAAUAGUGCUGCCUUUCCUGUGCUUCCCACGGCUGUUGUAGAUAGAAAGCAAUGAAUUCAGAAUUCUCAAGUCGGCCAGGCCAUCUUCUCAGUGAGCUUUGCCUCAGGCACCCUAGAUAUUACCACAUGAGAGCUAUAUUUCAUCUGUUCUUAAAUUUUUGCAGCUAAAGGACCACAUUUGAGGGUCGAAAUCCCUGCCACAAAACCAACCUUACCACCUUCUACUACUCAUAAGAAAAAUCCAUCAGAAUUUACUGGAAUUUAUUGCAAGAAUGACCUUCCAUUUCAUGAGUUGACAAUGAUGUGAAGCCUGGUUUUAUCAACUAUCCAAGUAAAGUAGUAACUUCAAGUCUUUAAUAGUACACAAGAAUCAUUUACAGGUCAAGUAUGGAACCUCUAAUUAUGAAAAACUGAUUCUCAGAGCAUAUUUUACCAGAUAUUGUGAGAAACAGAGAAAAAGCAGUUAACAAUGAAAGUAAUUACUGGCCUUCAAAUUCAUUAUUAACAGCAAGUCAAAUUGAAAAGGUACUGGUUCUGUUCUCUGUCAUUGACGUGAGAGAAUAUGGUAGAAGUAAGCGGAGAAAGAGACUUGGAGGCCAUCUGCUCAGGCCCUUUCACUUUUCUUCAGAAGCAAAGUUGUUAAUUGCUCAAGGCCUUCAAGAUCCCCACAUUCCGUCUCUUUCCGUAGAACAUACAUGUGCCAGUAUCCAGAUUUCUUCACAUAUUCUUCUUUCCAUGUCUCCCAUUUCAAAGAAGUGUUCCUUCUCAGGUGUAAAGAGUGAGGCUAAUUGCCCUGUCUUUUCCCGCUAACUCAGCUCUUCCUGAAACAAGUACCUUUCCUCAUUUCUGUAAUUUUUCUUCUGCUUGCCAUAAAAGGAAAUCAAGUUGCAUACCAUUCAAAUCUCCCAUCAGCUUUGUGAUCUUUGGAAAUGUUUUUUUCACAUUUUCUAAUAGAAAAUUUCAUAUACAGUAUGUACGAAAUGGAGUGAAAUGAUAAGGUCCCAUUUAUACGACACUCAACUUCAAUAGUUUCUAACUCAUAGUAAUCUUGUUUCAUCUAUACUUGCACUCGCUGCCAUUCUGUCAGAUAAUUUUAAAACAAAUAUCAGAUAUUAUAUCAUUCUCUAGUAUUUAUCACUAACAUUUAAGAGCUAUUUUAUUAAACAUAAGAGUAAUGUCAGGGUCUGGGGUGUUGGCUCACGUCUGUAAUCUCAGCAUUUUGGGAAGUCGAGGCAGGCAGAUCACUUGAGGUUAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGCUAAUACAGUGAAACCCUGUCUCUACUAAGAAUCCAAAAAUUAGCCAGGCAUGGUGGCGUAUGCCUGUGGUCCCAGCUACUUGGAGGCUGACAUGGGAGGAUGGUUUAAGCCCAGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCGCACCACUGCACUCCAGCAUGAGUGACAGAACUAGACUCUGUCUAAAAUUUUUUUAAAAAGUAAUGUCGUUAUCACAUGUAAAAAUUAACAAUGAUGCUUUAAUACCAUCAAAUAGCUAGUCAGUGUUUAUAUCUUCUCAAUUGUCUCAGAUAAUUUGUUAAAAGUGUUGAAUCAAGAUUCAAAUAAGACCAUAGUUUGCCAUCAGUUGAUGUAUCUCUUAAGUCUCCUCUCUCCUUCUGCAAUAUUUGUUGAAAAAUCUGUGUCGAGACGGGCGGAUCACGAGGUCAGGAGAUCGAGACCAUCCUGGCUAAUACGGUGAAACCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-500.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -543.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 642.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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