Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:122
Sequence Length
561 nt
GC Content
0.4314
AGCACUUCGGGAGGCCAAGAUGGGUGCAUCACCUGAGAUCAGGAGUUCCAGACCAGCCUGACCAACAAGAGUACUGAGCUGUCUCCGAAGAAUUCAGAUUAUUGAAUGUAGGCACCCUUUUCUGAUUUCCUUCAUCAAUUCAAUUCAGGAGAUGUGAUGCAAUGUGAUGUGUCAAUGUAUGUAUGAUCGAAGUGUCAGUCUCUAUAAGUACUCCGCUCCAUGAUCCUGGGGUGAAGUGCUACAAAACACAUUUUUGGUGGAGCAGAAAUAGUGCUGCCUUUCCUGUGCUUCCCACGGCUGUUGUAGAUAGAAAGCAAUGAAUUCAGAAUUCUCAAGUCGGCCAGGCCAUCUUCUCAGUGAGCUUUGCCUCAGGCACCCUAGAUAUUACCACAUGAGAGCUAUAUUUCAUCUGUUCUUAAAUUUUUGCAGCUAAAGGACCACAUUUGAGGGUCGAAAUCCCUGCCACAAAACCAACCUUACCACCUUCUACUACUCAUAAGAAAAAUCCAUCAGAAUUUACUGGAAUUUAUUGCAAGAAUGACCUUCCAUUUCAUGAGUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-135.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -145.4
Frequency: 0.0000
Diversity: 133.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((((.(((((.((((((.....(((((.((.((((...(((..((((((........)).)..)))..))).))))...)).))))).((((.....)))))))))).))).)).))))))........((((((((.(((((((((((((......)))))))..............((((.((((.(((.....((((((.(((((((......))))))).))))))......((((((((((......))))))).)))((((.....(((((.....))))).....)))).......(((((((((((((((((((......(((.(((((((.......))).)))).)))(((((...))).))..........(((((((............))))))).......((((......((((.(......))))).......)))).....................((((..........)))).........))))))..)).))))))))))).))).)))))))))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
........((((((.{,(((.((((((....{(((,,.{|}||{{,,,,(({,{(({({,,,......}.)}.}}).})))}))}},,.},{|||||....,}},,},...)))))).,,)})}.})))))........((((((((.(((((((((((((......)))))))..............((((.((((.(((,,...((((((.(((((((......))))))).))))))......{{{{{{{{{(..,,,,||}}}}}.}))||{|.....(((((.....))))),,,,,}}})}}}}...(((((((((((((((((((...,..(((.(((((({,,.....)}).)))).))){,{{|,..})}.},..........(((((((............))))))}...,,,.((((......((((.{......})))).......))))...,,,...............,{{{..........})},.........)))))}..))}))))))))))).))).)))))))))))))).))))))))
Back