Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:13
Sequence Length
565 nt
GC Content
0.4850
GACGUUUCAUAAUCUUUCUGUUUUUAGGAUGGGAGCUCCCUGCCUCUCCACCGUGCCUGGCAUCUGGAGCCUCUCUAGGUACUGCAUUUUGAUAAAUUGAAGGUUUGUGGAACGCUGCAUUGAGCAAGUCUAUUGGUACCAUUUUCCAACAGCAUGUGCUCACUUCAUGUCUCUGUGCCACAUUUGGAAUGAAGAGAAUCUGAACUAAGAUGGGGUGAAAGUAGGAAAUCAUUCCCCCAUGUCAAGUGCAAGGGCUAUCCAGUUAGAGGCCAACACAGAUGUCUGAUCAAAGCAAUGCUUCUCCAGCUCGAGAGCACAUCAUCACCUGGAGAGCUCAUGAAAACAGAUUGCUGGGCUUCAUCCUCGAGUUUCUGAUUCAGUAGGGCAGGGUGGGGACUAAGAAUAUUCAUUUCUAAUGAGUUCCAGUGGUGCUGAUGUUUCCAGUCCAGGGAUCACCGGUGGAGACCCAUUAGUCUAUGCCAUCCUAGUCCCACCCGCCUGACACCUCAUGCUCACCAGAAGGACACCUUGGGCUGACCAGAGAGGAGGGUUUCUGUGUGAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-174.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -188.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 189.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((..(.(((((....))))).)((((..((((.((((((......((((((((((((((((.(((((((((..(((((((.((((...(((((...(((((....))))).((((((.((((.((((.........)))).)).)).)))))))))))..(((((...(((....))).....)))))((((......))))((((.(((.(........).))))))).)))))))))))..((((.((......))))))....(((....)))..........((((.(((......))))))).......))))))))))))).......)))).)))))))).........(((((...))))).((.((((.(((((((.((((.((.....(((..((((((.((((((.(((((.......((((......)))).))))).)))).)).))))))...)))...)).))))))))))))))).))...(((.(((((.....(((...)))))))))))...)))))))))).)))).)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{((((((({.(((((,{,,,,|||||{((((({.{{,{|{{||||,.....(({{(({((((((((,,{|||{{{{{.,{{||||||||{|,,,.||||}.}|||||}}},}||||,((((((.((((.((((.........)))).)).)).))))))|||||..(((((...(({....}))..,..))))},{{|,,,...|}|{((((.(((.(........).)))))))})|},,}))))}.|((({.{{......||||||....{{(,,{{{{{.||,..,,..,((,{(((,{{...||||}},..,}.,,}})))))))))}}.,,....))))).})))))),}}...,,.(((({...}}}}}.({.((((.((((((((((((.((.....{{{..((((((.((((((.(((((,{{,,,.{{({......)}},.))))).))))}}).))))))...,})...)).))))))))))))))).})...||,.||((({{{{{({|.,.||||||,.,,,}}}}}})))})}})))))},))))),..
Back