Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:132
Sequence Length
581 nt
GC Content
0.4492
GCCUAUCGAAUACAGAACCUUUAGGAGUGGGACCCAGGAGCUCUGUUAACAAGGCCUCCAGGUGAUUUGGAACACAGAAACCAGGAACCUUCAGUUACUCCAGCAUGAAGGAAUCAACUGCUAUAGAGACCACAUUCCCUGGAGUUUUAUAAACUAUGCUGGUCAUCAGAUCACUUUUAGACAUCAUGUAAGUGUUGUUUUCACGUAUAACCAACCAAUGACUUUCAUGAUAGUCACAAACAAAAACAGAAUAGUGCUUUCCCCAAAUGGAAAUGUUUUAUGGUUCUGUCUUCUAGUUCCCUGAGACAGACACAUCUGAAGAUGCCACUCUGAAUGCCACCAUGUAAGGAAGCCUGUCCAGUCUAUCAGGGGAAAAGGCGCCACGUGGAUAGAAAUCAAACCAAAAUGCCACAGCCAAAGGCUGGCACCAAGGCCAGGCAUGUGACCAAGGCAUCUUAAACCUCCCAGCCUCAAGCUACUGUACGUAGCCACAUGAGUGAGCACAAGCAGAAUCAGCAAAGGGACACUCCAGCAAACCCACAGAAUGGUGAGAAAAAAUAAAUGAUGGUUGUUGUAAGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-145 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -157.1
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.......(((((.(((...((........)))))...))))).....)))).(((.(((..((((.....)))).))).))).(((((((((.....))).))))))........(((((((.(((((((((..(((((((........((.(((((((...(((((........(((((((((.((((((((.((........)).)))).....)))).)))))).)))...............((((.(((((((......))))).)).))))(..((((((((..((....))))))))))..))))))((((((((.......(((((.((((((..((..((((.(((...........)))..)))).))))))))............((....(((((..(((...))))))))....))...)))))........)))))))).........(((.....))).((((..((.(((((....))).))))..)))).))))))).))....)))))))......(((......)))..........)))).))))).)))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,,...,..{((((({((,{{,(({(({...{||.||{{,||||}.....}))},|||,((({{{((({.,..||||.|||{|||.(((((((({.....})).))))))........{{{,{{|,{{{{,{{||..||||{||,,.....,||.{{|||{{,.,||}}}},,,....(((((((((.{(((((((,,,........}}.,}},,,,,.)))}.)))))).)))...........,,..,{{|,{{(((((......))))).)),)}|}||||((({{|||,||...,))))))}}}}..},))))((((((((..,,...(((((.((((((..((..((((.(((..,,,...,,,)))..)))).))))))))............((....((((,.{(((...))))))))....))...)))))..,,....)))))))).........,||,,...|||{(,,,..||}||(((....))).}}}}..))})..,,,)),..))).}))))),,....,{({{.....,))}.,.........,)),,)))).})))).,)..
Back