Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:137
Sequence Length
5534 nt
GC Content
0.3699
GCAGGAAGUGGCAGGGUCAGGAAAAGCUAGGCCACAAGUUUUCCCUUGAGAGCCUUAGAGACUGCAUCUCACCAUGUUGCUCAGGCUGUUCUCGAACUCCUGGGCUCAAGCAAUCCUCCUACCUCAGCCUCUCAAAGUGUUGGGAUUAUAGAUGUGAGCCACUGUACCCGGCCCUGGUUGCAUUCUUCAUUAUUAGGAACAUAAGAGUCUAGCCCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCCAUGGUUUGAACUCUACUCACCGCAACCUCCACCUCCCAGGUUCAAAUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAAUAUCUGGGAUUACAGGUGCCUGCCACUACACUCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGGUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUUGUGAUCUGCCCAUCUCGUGCUGGUAUUACAGGCGUGAGCCACUGCGCCCAGCCUAAAAUAAUUUUCAGUGAGUUAUAAGAAAACAGCUGCAUUCUGUUCUGUUUUUAGGCCUGGCCAGAGAAUACCAGGAGACUGUAAGAUGUCAUGGUACAUCAAGUCAGUCUCAAGUGUCCUAUAACCCUGGCUUGCCAUCAGCUUAGAAUGUUCUCUUUUUCUACUGACCUGCCUUCCAUCUGUGGUCUCUUCCUUCCGUCUGCUAUUUAUCAUGUACUUAUUGAUGUGUGUCCCAGAAUGUUCAGAAUCAUCUGAUUUAAAAGAUUCUGUCCCAUUUUCAGUAAAAGUAGCCCAAUAUUUUGUUGAGAAAACACAGUGACUGUGCAUAUACCUACCUACUCAUUAAGGUAUCACUUGUUGGUCACCUAGAGUAUAAAUUCAUGGCGUGGAUAUGACCUUGGUAUGAGCCUGUUCUAUACUGAUUUUGUCCCUCAUUGGGGAAAGACACUAGGAGGAUGUGUGUAUAGUGAAUAGAGGUACAGAUUGGGCACAGGCAGACUCUUUCUUGAAUCUAUUUCAUCAAUUAGUGGAUUUUUUUUCUCCUAGCCAAGUUAUUUAGCCUCUUCCUAUAUGAAAUACUCCUUCUUUUCAUCUGUUUUUGUUUUUAAAUGAGAUGACAAUUCAUGACUAGUCUUGGUCCCCUUAACACUUAGUGAGUGCUCAACAAAUGGUAGGAAUUAUUAUGGAUAACAAUAAUUAGUGUAAGUUCAAUAUGUAAAUAAAACUGCCUUUUGUUCACUAUCACAUCGCUUGUCUCAUCGGGUCUCAUCAUGAAAUAUUGGUCAUCAUUACUAUGAGAUCCAUCUAUGGUUAAUAUUACUAGUGUGACCCUAAAAUAGGAUUCAUCAACUAGGUAUGAUCAUCCGUCUAUUCUUUCCUUAAAUACAUUGAGCAAAAUCUUCAGGGGCAGCUGUAUUUUUUAACUGCACAUGCUACAGGGAUUCUGAAGUGAAACAUGGUGAAGAACCACCCAAUCAGACAUUUGAAUGGGGACUGACAGUCUUAAGUCUAAAGAAAUUUCCUCUUCCUUCAUAGUAAUUAGCAAGAAACUUCUACAAAAGUUACAAUGCCAAUUACUGGAAACGCGCAUAUCAGGAGUUCCAUGGAGGACCAUUUCCAAGCAGUAGACAUCAUGCAUCAAUCUGCUUUUUGAAAUCCAGACUGAUUUUCCAAAUCAUUUUUAAAUAAGAGGCCUCAAGCCGUAUGUAAGAAACAAGAAAAUUUGUGCCUUAAGAGCAACUAUCAACUUAAAUCAAAGAGGGGUAAGAGGUAAGCUCAGGGGAUAGAGAAGAUUAACCUAACAACAAAUAGCCUUUGCUUACUUCUGAGAUACCUAGCAAAUGCUGCCUUUUUGAAUUUUGUGCAAUUAGUUUAGUACUUCAAUUACCUAGAUAUUUUUAAGUUAAACAAGCUCUUGAGUGAUUUUUUCAUCAAUUUACAUUGAGUUAUAACAAAUGUAGGAAUAUUUGUAUUUAAAAUGCACAAGAAAAUGCAAAACAUAUCUCUAAUUUGACCACUAAAAGGCCAGUUUCUGAUGAUAACUUUUUGCCAUAUCUUAUUAACUGUAAUGUAUCUUUAAGGAUGACACAUGGAAUAGUUCCAAUGUAUAACAGAAAGGAAAUCUGAUAUUAUACUUAAGUGCAUUCUGUACUCUGUGGGGAAAGAUGCAGAAUAUAUUACAAAGAACAAUGAAGACAUGUUUCAAAAGUAAGCAUUAAUUUAUUCAUUCAUUCAUUUAUUCCCUCACACUCUUAUUCAACAAACAUUUAUUGAAAAUCCUCCCAUGCGCAAGGUGGGUGUUCUAUCUAAAUUCUAUGAAGAACAAGACAGACAAGGUCCGUCUUCUCACAGAGCUUACAUUUUAGUGAGGUAAAGUUGUCAAUAAGUAUGCAAAUUAAAAAAAUGACAGGCUCAACUAAUGCCUCCAAAAGCAACUAUUUUUAAAGCAAAAUCUGAUUGUGUUCAAGUCUAGCAAAGAGUCACAAAAAUAUAUUUUUAGAAAUGAAGAUUGUUGACAUGGUAAGGUUAUUCAUUCUUUCUAUUUUUAUAAAUAAAUCAAUUAACCCUAUUUUAUUUUAAAAAGUCAUGCAAGGUCAAAAACGUUGGGAUGAUUGGUAUUAAACUCUGGUGGAAGAAGCUCCCUGAAUGCCUCCCUGACAUCAGUCAUACAGGUCAGGAAGCAAACACCUUUCCUCUUGUUUCCUAACUGCCCUUUUUACCCAUUUCAUAGCACACACUUACUCCGGUCACCAAACUGGUUACCAUCCUCCUGUGUUCUGUUUUUGUAAGAGGGCAUUUAUUUGGCCCUAGUUACCCAAGAAAAGGCAAUUAGUCUUGACAACUGCUGCAAAGAGAAAAGACGAGAUGAUGGAAACAUUCAACACUUAAAAAUCCUUAGAUUUCAAGCAUUGGGGUUUCUGCCCCUAUAGAUUUCUGGGAGUUUGGGACAAUUAAAAUAUAUCUUUUAUUUUUUUAAAAAAAUAUAUAUAAAUGAAUGCUAAAACAACUCUUAAAAGGAAAUUGCUUUAUAUAGUCUGGCUAUGAUCAGCAAAACUGGUAUUCAUAUUUACAUUUGUUUAUUAUAUCAGUGAGGUUUGAGAAUCAUUUAAAAGAAUUGUGUUCUAAUUCAACCUAAAUUCCCUUCCUGUUAAUCUGAGCCAAAUGUCCCAAACACAGACAUGGCAGUUUUUAAAUCUCUGAAAACUAUUUAAAAACUAAUAUUAAAAAUAUAGUUUUAAAAUAUAUUGCAUAUACCUGUAUACUUAGGUAUGAAGAAAUUUCCUCUUCCUUCAUGGUAAUUAGCAAGAAACUUCUAUAAAAGUUACAAUGCCAAUUAUUAGAAACAUGCAUAUCAGGUGUCCCACGUAGGACUAUUUCCAAGCAGUAGAGAUUAUGCAUCAAUCUGCUUUUUGAAAUCCAGACUGAUUUUCCAAAACACUUUUAAAUAAGAGGCCUCAAGCCAUAUAUAAGAAACAAGAAAAGUUGUGUAUAUUUGUAUACAGGUAUAUACGAGUGCCCGUAUAUGCAAGCUGAGGUGGAGAAAUUGAAGACACAGAUUAUGUAAGCCAUUAACUCUUUAGGGGAGCAAGCUCUGAUGUUCCCACUUGAAGACGGGAGAGGGGAGUCCUCUCAUGCUUGCGUCUCACUGUAACUUUUAUGCUUUUGUCUGUGGGUGUGUUUGUUCAGUGCUUAGACUGAACAACAGUGACCUCUUUGAAACAAGAGGAUAUACAGUUCACGUGCCACAUAAUGACUUUCAGUCAAUGACAGACUGCAUAUAUAAAAAGCACAUUCUAAUAGGACCUUUGAUAAUCGUUUUGUCUUCUUGACUAUCAUCUUCUCUAGGAGAAAGUCUUCCCUGAUACUCUGCCCCCUGCCUCCACACAUACACAUACACAAACACUCAGAUAUAUCUCUACCACACAUACUCCUGGCUAGGCUAAGUGCACCCUUUUCUUUUUCUUUUUCUUUUUCUUUUUCUUUUUCUGAGACAAGGCCUUGCUCUGUUGCCUAGUCUGGAGUGAAGUGGCCUGAUCAUAGCUUACUGCAGCCUCCAACUUCUGGGCUCAGGCGAUCCUCCCACCUCAAUUUCCCAAGUAAUUGGGACUACAGGCAUGCACAAACAUGGCUGGCUAAUUAUUUUUAUUAUUAUUAUAAGUAGAGAUGGGGUCUCACUAUGGUGCCCAGGUCGAUCUCAAAGUCCUGGGCUCAAGCAACCCUCAUGCCUUGGCCUCUCAAAGUGCUAGGAUUACAGGCAUGAGCUAUCAUGUCCAGCCUAGCUACCCCUUUUCUAUACUUUCCUAGCAUCAUGUGUGGGUCUUUCUCAUACUAUCUACAGCACACUGUGAUUGUGUAUUUACCCAUAUUUCUCCCAAAUGACUAUAAACACCUCAAGGGAAAGGAUUAUAGCUUAUUCAUAUUUGAAUCCUUAGUAUUUAUGACAAUGCUUGGCUCAUAAUAAGCUCUCAAGAGAUAUUCAUUCCAUUGAAUUGAAAUGACUUCCACUUGGGUUUCACAGUAGAAUACUCAUUACUCAUCAGACUUACUCAGGGGACAAGUCUCUGGCCUCAUUUUCAUUUGCAUCUUGGCCAUGAUUUUGCCUACUGUCAAUCACCAUGAAGUACAGAAAAGCAAACUGAGCUAUGGUGAGCCAAAUUAACUGGACCUAAGAUGACCUCAUCAGCAAAGCGCCCUAAGCAAUCAAGCAAUCGGGUCAGCUAGUUGCAGCCUAUAGUUAUCGUGGAAAACUGGUUGCUACUUUGAUCUCAGCUCACCUUGCCAAAUACUCCUUUUGUUUGAAAGAUAGUCAUAACAAGUACAAAACAACACUGAGUGAAUAUUUUUAAUAUUAUAAGCACCUAGAUAAAUUUAAUUUCUAUUUCCAUUAAUGAUCUGAAUAACCUAAAUUCUUCUAAUACCUAUAUUUGUCCAAUUUUAAGGUAUUCUGACUUAGGCAGAAAUUGGGCAAUUAUCUGAUUAAUUCAGGCCAAUAUUUUUAACACUGGAUUUCUGCAUCACAAGAAUUGUUAAUU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1351.87 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1460.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 1401.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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