Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-BMP6-106:145

Sequence Length

1490 nt

GC Content

0.4356

GAGAGAGAGUGAGAGAGGGGAGUCAGCCCCGUCACCCAGGCUGGAUGAGGUGUAGUGACGUGAGCAUAACUCACAGCAACCUCAAAAACUCCAGGGUUCAAGAGAUCCUCCUGCCUCAGCCUUCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGUGUCUUUGUGAAGCUUCCUAUCUUUGCUUUUCAACUAAGAUGAAACAGCAUUUAAAAGAAAAUGCCAUGUGAGAUGAGAUCAGGAGAAUGGAUUCUUUCUUUCAUCUGAAUAGAGAGCUGCUGUUCGAGAUUCUAACUCAAAUAGCUCAAAGGACACCUUCUCCGGGAAACCUUCCCUGACUUCCGACGCUGUUUCCUGUUACCCAUGAUGUACAUUAGAACACAGCAACUAUUUGAGUGAAAUAAGUAUUUUUAUUUAUUUCAAGAGGAAAGCAAAGUCGAAGGGUGUUCAGUGCAGAGCCAGGAGAGGACACUAUUGGAAAACAGAGAUGUGAGAAAACCCUAAAACAUGGUGUACUCAUGCCUGAACUUAGCCUGUCUUUCACAGCAAGGCUCAUCAUUUCUGGGUUUACUACAGAACCUCACCGUGUACAGCAGGCCUCCUAUAGAAAGGCUACAGUUUUGCUUGACCAGAUGUUGCCAAGUUUCAAAGUCAAAUCGGUUCAUCUCCUGGCUAUCAGCUAAAGGGUGUUGUAUUUGUAAGCAUUGAGAACUUCUAUCUACUGCUAUUGUAUUUUGCAUAUUUGUAUUUUCUGAGUUCUAUUUGAGAGAGACGGAAUUACGCAUUUCCAUAUGGAUCAUCCUCUUCCCUAUGUAUGUUGCUUUAUUGCCUUUUGGAAGAAAAAAAGUGAGAGUUGCAGUCUGUAUUUAGGCCAUUUCUAUGUUCUUUAUUGGGUUACGUUUGAAUGCCCAAUUUGAUCUCAAUGGCACGUCCUUUGUAACAUAAAAUAAAACAUGGUGCUCAGGAAAAGUAACGACACACACAUCCAGGCCCUUUCAUAGCAGUUGGUAAAGCUUAAGCCUUGCCUCUCUGUGUGGUAGUUUCCCUUCCCUUUCUUUUCGUUCCCUGUGACAAGCAGCCAUUGUCCCCUUGGUGAGAUCUGCAAUAUUACUUUGACCCCAGCCCAUCAAUCUGCCUCAAUUGGAUAAUGAUCUGUAAUCACGUUCUUUCAGGGGAGUCUAUAAAUUUGCCAAGGCCCCAUUCUCUUCUGAAGGACUCCUUAUGUUCACUCCCAUUUGUGCAAAUGUGCUCUCUUUUACAGGGCUAAAUAGCCAUGCACAUGGUCCAUUCUGUGAGGAGGCACCGGGCGGUUCUCUGUUGAUUUUCCACGCUCUAGUCUCUUAAAGGAGACUAAGGCUGACAUGCAGGGACACAGUGGGGGGGUGGCCCGAGCCAGGCCACAUCACAGGCAGCCGCUUUUCUCAUUAAGACUGACCCAUCAUUAGGUCACUUUGUGCCAUCCUUGUAAUCAAUGAGCUUAAUGUUUAGUGCAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-409 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -439.2

Frequency: 0.0000

Diversity: 396.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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