Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-BMP6-106:149

Sequence Length

745 nt

GC Content

0.3946

GUGUUUUUUAAGCUUGAAACCAAAUAAAUUACAAACUCCCUGAAGAAUUAUACACUUGAGCUCUUUUAGGUAACCUCUGGAUCCUCAGAACCUAUUUUAUGGCUUUGGAAGCUGUUAAAACAAGUCAUCAAGUAGAAAAAAGAAAAAAAAAUGUGUUGGGAAAACCAUCUGUGAGUGACAGACUAUAGGUGACACUUGCAGUAAGGUAGAAAAGUAGGUAUCUUGAAAAUAGUGUGAUGUGGCAAAUUUAAUAAUGUCCUGCUGCCUUUUGAAUACAUGAAUGCAAGAAACAGGGAUAGUUGGUGAAUGAUUCACAGAGUCUCUAUCACAAAGGACAGGAGUGCAAAUGUGUUUCCUCCUGAGCUUAGGUGAGUUCAGAGAAAAAUGAAGGUGACUCGCUGGGUGAAGUAUCAGGGAAGGAAGAAAAUCAGGAACGUUCUAUCAGAAAAAGAACAUCAGGGACGUUCUGUCAGAGAAGGAAGGUCUCAAAUGCAACUCACAUUUUCAGAUAUCAUUGAGGGGGGAAGAAAAUUCCAAAAUUUAGGGCUUUAAUGGCAGAGAGCAUUUUGAGCUAAAGUAUAUUAGCUAGUAGGUAAUAGAAGGGAAUUAAAUGGGCAGUGUUCAUCUUGGAGAAAGAGUAGGUGAUGUGGUUUCGUGGCUGUGUCUGGAAAAGCAAACUUUCAUGACAUGGGCUACCUGAGAAAGUAGCCUUAGGUGGUGGUGACAGAAGUGUUCACUUGUACCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-186.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -203.25

Frequency: 0.0000

Diversity: 174.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..........((((((((((((......((((...((((..((.((((....((.((((.((((((((....((((((((.((((((....((((((.(((((((.(.............)))))))).)))))).....................(((.....))).(((((((((.((.........)).)))))))))...............(((((((.((((...((((((.((.(((............(((((..((((((........(((((.........((((((..(((.((((...))))))).)))))).((((.(((..((((((.(((....)))...))))))..)))..))))))))).........))))))...((.((((........)))).))...........)))))..(((((.........)))))....(((((.((((.((...)).)))).)))))...))).)))))))))))))))))))..)))))).((((.....))))...((((..(((((.((..((.....))..)).))))).)))).......)))).))))..))))))))..)))).))......)))).))..)))).....))))......)))))))).))))(((((..((((.......))))..)))))(((((((........)))))))..((((..(((((((....)).)))))..)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

..........(((({(((((((.,,...((((...((((..((.(({,...,(({(,,,,((({((((,...,(((((({.,(((((,...((((((.((((((({(.............)))))))).)))))).....................{{{....,||},(((((((((.{{.,,,...,,)).)))))))))...,,,.........(((((({{((((...((((((.((.(((..........{((,((,((((((((((,.,.,.,.....},......((((((..({.(((({...}))))}}.)))))).}}|,}}}|}.|||,||.|||....,,|{{{||{(({{{(({,{{((((((((........}},...,})))))))}}})...,,.)))))},}))})}.....,,,|,..(((((.........)))))....(((((.((((.{(...)}.)))).)))))...))).))))))))))))))))))).,))))),.((((.....))))...,{{{..{((((.{{.,{{.....)).,)}.})))},|,,,...,,,,))}}.))))..)))))))}..)))),,)}},}}})))).))..)))).....))))...}}.)))))))}.))))(((((..((({.,....,))))..))))){((((((,{,,,...}}}}})),,||||,,(((((((....)),,))))..}))).