Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-BMP6-106:154

Sequence Length

1330 nt

GC Content

0.4248

GGUAAUCAGCUGGGGUUUCCUUAGGGAGGUUGGAAGGUUUGUUCUUUCUCUCUUUGCAGUAAAUCUUGCAGAUUCUAACUCAAAUAGCUCAAAGGACACCUUCUCCGGGAAACCUUCCCUGACUUCCGACGCUGUUUCCUGUUUAACUUCAGAAACUGGGGGUGUCUAAUGUCUGCAACAUAACAGGACUAUUGUAGGAAAUUCUGAGACUCUAUAAGCACUUUUAAAUGUGAAAAUUAAGAAGGCAUCCCAGAAAUGAAUGGGUCCAGUGCUCUGAUUUAAGAGUGUGUGACCUGUCGUCAUUCAUCCAGCAGACCCAAGCAGGCUUAGAGAAAGUAAGACGGACCCAUGAUGUACAUUAGAACACAGCAACUAUUUGAGUGAAAUAAGUAUUUUUAUUUAUUUCAAGAGGAAAGCAAAGUCGAAGGGUGUUCAGGGCUACAGUUUUGCUUGACCAGAUGUUGCCAAGUUUCAAAGUCAAAUCGGUUCAUCUCCUGGCUAUCAGCUAAAGGGUGUUGUAUUUGUAAGCAUUGAGAACUUCUAUCUACUGCUAUUGUAUUUUGCAUAUUUGUAUUUUCUGAGUUCUAUUUGAGAGAGACGGAAUUACGCAUUUCCAUAUGGAUCAUCCUCUUCCCUAUGUAUGUUGCUUUAUUGCCUUUUGGAAGAAAAAAAGUGAGAGUUGCAGUCUGUAUUUAGGCCAUUUCUAUGUUCUUUAUUGGGUUACGUUUGAAUGCCCAAUUUGAUCUCAAUGGCACGUCCUUUGUAACAUAAAAUAAAACAUGGUGCUCAGGAAAAGUAACGACACACACAUCCAGGCCCUUUCAUAGCAGUUGGUAAAGCUUAAGCCUUGCCUCUCUGUGUGGUAGUUUCCCUUCCCUUUCUUUUCGUUCCCUGUGACAAGCAGCCAUUGUCCCCUUGGUGAGAUCUGCAAUAUUACUUUGACCCCAGCCCAUCAAUCUGCCUCAAUUGGAUAAUGAUCUGUAAUCACGUUCUUUCAGGGGAGUCUAUAAAUUUGCCAAGGCCCCAUUCUCUUCUGAAGGACUCCUUAUGUUCACUCCCAUUUGUGCAAAUGUGCUCUCUUUUACAGGGCUAAAUAGCCAUGCACAUGGUCCAUUCUGUGAGGAGGCACCGGGCGGUUCUCUGUUGAUUUUCCACGCUCUAGUCUCUUAAAGGAGACUAAGGCUGACAUGCAGGGACACAGUGGGGGGGUGGCCCGAGCCAGGCCACAUCACAGGCAGCCGCUUUUCUCAUUAAGACUGACCCAUCAUUAGGUCACUUUGUGCCAUCCUUGUAAUCAAUGAGCUUAAUGUUUAGUGCAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-347.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -378.37

Frequency: 0.0000

Diversity: 330.03

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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