Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:33
Sequence Length
1150 nt
GC Content
0.4878
GCGGGCGGGCCGUUACCUCCCGCGCAUGCUCUAUGGGGUAGAGACGCUAGGCCGGCACUGCCUAGGUGGGCCGGGCGGUGCGAGGGUCGCCUUUCAGCCUUUACCUCUACCCACUGAAAUGGAGUAGGUCGGUGAGCGCCGAUCUGCUGGAGAAUCUCAUUAUCCCAUCGGCGCUCUGCCUGCUCCUGGCCUCCAAGCCUCUGAAGCCCCUCGGGUUUCAGCUGCCGGCUACCCUCGAGCCCGUGGUGCCCACGAGAGAGGCGACUUUACGUCAGCGGCCCUGGGCUGAGAUUUGAGAACGCGACCAAGUGGAGAAUGUUGGAGCCAGAUUUUAAAAUCCUUGUCUUCCUUCUGCGUGCUACUUGAUCUAAAUGAGAUACGGCAAAGUCACAGAACCUGUUUUUAUGUUUUUGCCUGAUUCAUACGGGCUUCUCCGGUGAAGAUGGGCCUGAAGUAACGCUUGGGUUGCUUCUGACGUUAUAACUCAUCCUGUAGCUGCAGCAACCGUGGUCCUUGCAACCUCAUAAAAAUGUUGCCAGCAUUGUUUCGAUAGUGCUGCUUAAUUCUUGGAAGGCCUCUUUGCUUUCUUCCCUGAGGUUCUUCGGACUUCACACAUUCCAGCAGUAGCUCUCUCAGCUCCUGUCCUGCACAGCUUUGAAGUGCUGUUAACCAACAGGACACAGCCCUGGUGAUGGCUUUCUGAGGAUGACACGAUGGAGGCUUCUCCAAUAGCUCUAAAACUGCGGUGUGGAAAACAUUCGGCAGCCUCAAAGAGCGGUCUUGUUGACCCCAACUAUAUCAUUUUUCAUCAAAAUCAUUCUUGUAAAGAAUGACCAGGCAACACUCUUUGAAAAUUGGAGGCCAUUUGCAGCUGCUCUCUGUUGAGGAAAGUGAAUAAUAGGGUGCCCUCAAGGAAUUGCAAAGGUAUCACUCAACAGAAACUUUCGUGUCUGAAGAAAACUAGAUCAUUUUAUCAUGGUAGGCAUGCUGAUAUGUUUGCUUUAAUAAAAUGCCAUAUUUCUGCCUUUAAUCUCUUGUCAACCCGCUAUUAAAAAGCCCCAAAGUGCAUGUGUGCAGCGCAUGUAAACACUUGUGGUUUUGAGGUUACCACAGAACAUACUAAUAAAGCAUGUAAUUUGUGUUUUGUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-389 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -407.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 244.0
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((.......)).)))))((((((.((.((((((.......((((((.......))))))(((((((((((....(((((((.(((((((((................)))))).(((((((((....((((((((((.....(((...........))).)))))))))).))))))))).(((......))).(((((((((...))))))))).....))).))))))).)))))....))))))......((((......))))(((((.....(((.((((((.(((...((((.(((((((...((((.((((..((((............))))..)))).)))).))))))).))....(.((((((((..((((.......(((((((((((......(((((.......))))).......)))))))))))...((((((((......))))))))(((.((....)))))....((((((((((.....((((.((((......(((......(((((((((((((((....)))))))).........((((((((((((((((..........((((((((...))))))))..((((((((.((.((((.((((((((..(((((((.(((((........))))).......))))))).)))..))).)).))))))))).)))))...))).)))))))).)))))..(((((....((((.(.(((.....))).).))))......)))))((((.....)))).........................((((((((...))))))))...))))))).....)))......))))))))))))))))))..(((((((((....((.....))..((((((..(((....)))....)))))).))))))))).)))))))))))).)(((((..((...((((((((...((((((((((....))))))))))...))))))))...)))))))))))).))))))..)))...)))))........)))))).)).)))))).....(((((...(((((((((((((.........))))))).((((.((.....)).)))).....))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
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