Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:44
Sequence Length
1556 nt
GC Content
0.4679
CCCGCGCAUGCUCUAUGGGGUAGAGACGCUAGGCCGGCACUGCCUAGGUGGGCCGGGCGGUGCGAGGGUCGCCUUUCAGCCUUUACCUCUACCCACUGAAAUGGAGUAGGUCGGUGAGCGCCGAUCUGCUGGAGAAUCUCAUUAUCCCAUCGGCGCUCUGCCUGCUCCUGGCCUCCAAGCCUCUGAAGCCCCUCGGGUUUCAGCUGCCGGCUACCCUCGAGCCCGUGGUGCCCACGAGAGAGGCGACUUUACGUCAGCGGCCCUGGGCUGAGAUUUGAGAACGCGACCAAGUGGAGAAUGUUGGAGCCAGAUUUUAAAAUCCUUGUCUUCCUUCUGCGUGCUACUUGAUCUAAAUGAGAUACGGCAAAGUCACAGAACCUGUUUUUAUGUUUUUGCCUGAUUCAUACGGGCUUCUCCGGUGAAGAUGGGCCUGAAGUAACGCUUGGGUUGCUUCUGACGUUAUAACUCAUCCUGUAGCUGCAGCAACCGUGGUCCUUGCAACCUCAUAAAAAUGUUGCCAGCAUUGUUUCGAUAGUGCUGCUUAAUUCUUGGAAGGCCUCUUUGCUUUCUUCCCUGAGGUUCUUCGGACUUCACACAUUCCAGCAGUAGCUCUCUCAGCUCCUGUCCUGCACAGCUUUGAAGUGCUGGUGAUGUCAUUGAACUCUUAAGUGCAAGAUGAAACAAGUCUUUCUGGGGUUCUAAGUAGAGUACUGAGCUGUCUCCGAAGAAUUCAGAUUAUUGAAUGUAGGCACCCUUUUCUGAUUUCCUUCAUCAAUUCAAUUCAGGAGAUGUGAUGCAAUGUGAUGUGUCAAUAGAUAACAACAAUUUGCUCUUCUCAACUCCUUUUGCCAGCACAGGGGAACAAAUGACAUGAUAUUUACUCUGCAUCUGAUAGCCUAUCACUUUACAAAACAAUGUUUGAGCCUGGGUGCAGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUCUGGGAGGCUGAGGACACAGGACUGGGCUGUGGCCCUUGGCGAGCCUCCCAAGCUAUUCAGUGAUGUUAGACAACCCACUUACCUUCUCUGAAAUUUACUUUUCUUAUAUGUAAAAUGCAGCUAUUGUACAGGACACAGCCCUGGUGAUGGCUUUCUGAGGAUGACACGAUGGAGGCUUCUCCAAUAGCUCUAAAACUGCGGUGUGGAAAACAUUCGGCAGCCUCAAAGAGCGGUCUUGUUGACCCCAACUAUAUCAUUUUUCAUCAAAAUCAUUCUUGUAAAGAAUGACCAGGCAACACUCUUUGAAAAUUGGAGGCCAUUUGCAGCUGCUCUCUGUUGAGGAAAGUGAAUAAUAGGGUGCCCUCAAGGAAUUGCAAAGGUAUCACUCAACAGAAACUUUCGUGUCUGAAGAAAACUAGAUCAUUUUAUCAUGGUAGGCAUGCUGAUAUGUUUGCUUUAAUAAAAUGCCAUAUUUCUGCCUUUAAUCUCUUGUCAACCCGCUAUUAAAAAGCCCCAAAGUGCAUGUGUGCAGCGCAUGUAAACACUUGUGGUUUUGAGGUUACCACAGAACAUACUAAUAAAGCAUGUAAUUUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-498.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -523.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 298.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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