Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:6
Sequence Length
1245 nt
GC Content
0.4594
AGUUACUGGUAGAAAGGCCCCAAGGCCGGGCUUCGGUGGCUGCAGUAGACUGGAUCUGGAUCUCUAAAUGGCAAUCUAUUGACAUGGCUGCCAGCGUAAUGGAACCCCUGAUUGAUACAUGGACCCAUGACUGUCCACAAGAAAGACUACAUUUCCCAACUCCCAUGCAUCUAGAUGUGAUGGCUUGAGCUGCAACAGCCAUCUUGGACGAUGAGGAGGAAGCCAUACAUGAAUGUGGCAGAAAAACAAGAGAAGAAGCUCGGCUCACUCAUGACUAUAGAGUUGCCAAAUCUUGCUUUCUUCAAGAAAAGUGUCUAAAUGACUUUCUUCCUAGCCUUCAGUGAGAAUCCAAAAACCUCUAUUGUUAGGAAAACCCCCAGGAAGGGCAGAAAGCAACUGAAACCUAGCUCCCCUCCUCACCCCUGUCCCUGCUCCCCAAAGACUAAAGGUUGGAUGGGCCUGGGUGAUAUGAUGACAUAUGCCAAUCUCGAUCACGUGCCAGAUGCCUCCAUGUCAAUCUUCUGGCUUCCCUGGGUCACACUGGAAGAAGGAUUGUCCUGGGCCACAUAUAAAAUACAUGAACACUAACAAUAGCUGAUGAGCUAAAAAAAAAAAAAAAGAAAUUGCGGCCGGGCGUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUACCAGCACUUUGGGGGGCCGCGGUGGGCGGAUCAUGACGUCAGGAGAUCGAGACCUUCCUGGCUAAUACAGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAGUUAGCCAGGUGUGGUAACGGGCGGGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAAGAGAAUGGCGUGAACCCGGGAGGUGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUCGCGUCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCGAGACGCCGUCUAAAAGAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAUUGCAAAAAAACUCAUAAGUUUUAAGAAAGUUUACGAAUUUGAUUUGAGCCACGUGUAAUGCUGUCCCAAUGCAUCCUCGGGGCCGUAGGUCGGGCAAGCUUUUUCUACGUAACCAAGAAAUAAAAUUUGUUUUGCUUAUGCCAUUUAGUUUUGUGUGUGUGCGUGUGUGUGUUUUUUCUGCCACAUAUAUAGCUAAAUCUAGUCCUGAUUAUGUCAAAGGUUUUAUUUGAAUGUUUUUGUCCACCUGGCAAAAUCUUAUUUAUUCUUCAACACUCAUCUCAGUAUAAACUCUGUAACUACUUUUUU

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-358 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -381.3
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((.....((((....))))..((((((((..((..(((((.((((..((.(((((((...((((..((....))(((((((((((.(((...((..((((......(((..(((.((((.(((.((((....((((.......))))....(((((((.(.(((((....(((((((((.....))..)))))))))))).)))).))))...((((((......))))))..........(((......)))(((..((((.........)))).)))...(((((.......))))).....(((.....))).(((((((.(((((.(((((((...........))).))))..)))......((((((.(((.(((((..........((((((..(((.(((..(((...(((..((.....))..)))....))).))).))).)))))).....((((((((......((((.(........).))))......))))).)))))))).))).)))))).....))))))))))))).))).)))))))..))).....................(((((....)))))...............(((.(((((.(((((((((....))))))))).....)).))).)))))))..))))).).))))).)))))..))))))))))).))(((..((((((((((....((.......................))....))))))))))...))).((((((....))))))....)))))))))..))..))))))))..((((.(((.(((..((((((...(((((..((((((((..((....))..))))))))))))).)))))).(((.(.(((...))))))).........................(((((.....((((((....)))))).....)))))..((((..(((((..((((.(((..((((.........))))..((((((((((((((.(((((((...(((((.........))))).....))))))).)))))))..((((((((.((((((((.(((...............))))))))))).))))))))...))))))).....(((((.......)))))...........))).)))).)))))..)))).........)))))))))).......)))..))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
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