Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:65
Sequence Length
3341 nt
GC Content
0.4122
GGGUAGAGACGCUAGGCCGGCACUGCCUAGGUGGGCCGGGCGGUGCGAGGGUCGCCUUUCAGCCUUUACCUCUACCCACUGAAAUGGAGUAGGUCGGUGAGCGCCGAUCUGCUGGAGAAUCUCAUUAUCCCAUCGGCGCUCUGCCUGCUCCUGGCCUCCAAGCCUCUGAAGCCCCUCGGGUUUCAGCUGCCGGCUACCCUCGAGCCCGUGGUGCCCACGAGAGAGGCGACUUUACGUCAGCGGCCCUGGGCUGAGAUUUGAGAACGCGACCAAGUGGAGAAUGUUGGAGCCAGAUUUUAAAAUCCUUGUCUUCCUUCUGCGUGCUACUUGAUCUAAAUGAGAUACGGCAAAGUCACAGAACCUGUUUUUAUGUUUUUGCCUGAUUCAUACGGGCUUCUCCGGUGAAGAUGGGCCUGAAGUAACGCUUGGGUUGCUUCUGACGUUAUAACUCAUCCUGUAGCUGCAGCAACCGUGGUCCUUGCAACCUCAUAAAAAUGUUGCCAGCAUUGUUUCGAUAGUGCUGCUUAAUUCUUGGAAGGCCUCUUUGCUUUCUUCCCUGAGGUUCUUCGGACUUCACACAUUCCAGCAGUAGCUCUCUCAGCUCCUGUCCUGCACAGCUUUGAAGUGCUGGUGAUGUCAUUGAACUCUUAAGUGCAAGAUGAAACAAGUCUUUCUGGGGUUCUAAGUAGUUUCUAGGGCUACAUGAAUCAUCUGAAGCCUCUUCCGGAUGCUAUAAGCAGCCAUGGAUGGGCGGAGAAAAGAUCCUUGGGCCAGCGUCUCCCUUAGGGUCCUUCCUGCCAUGAUAUUGUCGUCUUCAAAGUGUCUUCUGUAAAGACUUCUUCAGACUGUCAAUAGGAAGACUGAUAAACUCAGUUCAGAUGCGAGAGGAAAUCGAGUCAUCAUCAAUGGCACCUCAUGUUAGCCUGCCAUGGCAACAAGCUCAUUGAUUGAGUAAAAGAACUUUCAGAUGCACUAGCUGGUCUUUAACGGGUUGCUGAAAGCACAGAUAAGACGACUGAGGGAGCCGACUGAAUUUCCAUGGAUAUAUACAAAGGGAAUGGAAAAUCACAGUACGAUUUUUCAUUGGCUCCUGAUAGAGCUAGGUCCUUGUAUAAUUCUAAAACUGGUGUAUAAAACAAUGUCCACGCCAUUCAUUUUGGUUAUAACUAUUAAGGGGAAGGGAGAUGAUGUCUGUGGAAUUGCAAAGUAGUUUGCACUAGAAUUUUCUAUUACAUAUGCUCUAAUAGGAGUAUUUUCCUCUGUUACAUUAUGACUUAUGUAAUAAUAAUAGCUAAGGAUUACUGAGGGUUUUUAUUUUCUUUUCUGCAUGAUCUUGACCGUUUUUCGAAACAGUCCUUGUUGCUGGAUACUAUUUAUGUCACCAUUUUACAAAUGAGAAUGCCAAAGUUCAGAGUGACAUCCAUCUAAAAGAGGCCAGUUUCAGCCUUGAACCCAUUAUACUCUAAUCCCAUUUUCAAAGUAACUCUUGGUUUUCUCAAAAGGCCUUUAAAUGUAUGGAUAAGCCAAUAUGAGGGCAGCAAUGUUGUGGUUAAGUGUGUGCACUUUGGUUGGACUCUGCCGAAGGCCAGCACCACCAUUUAGUAGCUAUGUGAACCAGUGAGUUACUUAAAACCUAUACCUCCACUUCCUCAUCUGCAAAAUGGGGUUGUGGUAAGGCUGGAAUAAGUUAAUGCAUGUAGCAUGUUGAGAAGGCACUGUCUAAGCGCAUGGCACAUGGUAAGCAUGUAGGAAACAGCAACACAUGCCUGGGUCUGAGUUCUGCUCUGUCAUGAUGAUUGGUGCCCAACGGGAAAAGCUCUUCCGCACCAGCGUUUUACAAGCCUAGCUCCUCCUUUUCCAAAACAAGUUCCCAGGCCAUGGUCAAUAUCAACAUUCAGGGGAAAUACAUUCUGUUCAUUGUAGAUAUGACAGUGAGAAUAUUUGCUGAAUAACAAUUAAGCUAUCUGAUUGCGUAAUAGUUAAAAGGUUUGUUUUUACCAUCUGUGAAUUAAAGCCAAAAAUAACAACCAAUUCAUAGAAUAUUGUGACGGUUAUAGGAGAUGCAGCUUGUCAGCUGCUCAGCUCAGCGGCCUGGGCAUGAUUAGAAUUCCACACAUAAUAGUGAUUACCAUCAGUAUUAUUAUUAUUAAGGCAACACAGUGAUCGUAGUAAUGGUAAAACAGAGAGAUCUACCUAAUCCAAAAUUCUAUUCAACAAGGGAGUUUCUACAUAUAGCCACUAUGGUUUCUAAUUUUCAAAGAAUCAGCAUAUAAUAAAAUGCUCUCAAUAAUAAAGCUGAACUGAAUAUAUUAUAAUAACUUAAUGAGGCAGAAGACAUUUGAGAUGCCUCAAUUAUCAAUGUGUUUCACAGAUUCAAAAGUGUAACUUUAUACAUUUAUUCAAUAGAUAAAACACUGACUAGGUCCGCUUAAAGUUGAAAUAGAUUUUUGGAUUCUCUCAAAGUAUAGGGCAAUAACAAAUAUAGAAGUUUUCUGAAAAAAAAUAAGCAAAAUAGAAAUAGUACUAUUAUUAGUUUUAAAAUAUUAUAAAAGAAUUUUAAAUGAGACAAAAAUAAUAUGAUGGCAAUAUAUGGCCUUUUACAAAGAGAGGAACUGAGGCAGGGAGGAGAAAUAAUUCUAGAAUGACAUGCUGGUUAGAGGUAUGAUGUGUCGGACCACAAGAAUGAUGUGAUUCUGACUUUUCCUUUAUUUACAAAUCACUUUGGAUAAACCGAUGGCUCUUGCUGAGCCCCUGGGUUGGUGGAGGAGUAACAUGCCUGGGAGUCGAGCAUCCUAAGACGUGCACCCUGAGGACUGCAGGAAAAGUGCAGAAAUUAGGUAGAAAUAGGGCUUGUUUAGCAUUCAUGAUGGCUAGGUGUCUUACUGCAGGUGUCUUAAGAAACUACCCAGUAACUCACUGAACCAGCAACUCUGUGCAUGGCCUCCUGAGAGGUGAGGGACACAAAGAUUUUAUCAAGAGUGAAGCAUGUGUCUGUGUUCAAGUAUCUUGCAAAAUGAAGACAAAAGAAGUAGUUUGCAAUUAGCUCUUAGUUCCUACCUUUCAAAGAAGCAUCCGCCAGUCAGGUGAGAUGAAACUGACCAUGAAGAGAAGCUUGUAUCUGUAUAAAAUGCAAACCUGUUUGGACAGCGGAAUGGGGUUUGCUUCAAACUUCAGGGUGCAUUUAUAUAAAGCAACAGAGAGUGCACUUUCUAAUAAAAAUAAAAUGAAGCUCAAAUGGCACAAGAGUCUCCUUAUAUUUAAAAUGGUUCUCGUAAAGUAACAUUUUGAUGAUUUAAAUGGAAAUGAAUCAGAACAUAUAGAUUAAAUUUCCUUGAAAAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-953.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1016.6
Frequency: 0.0000
Diversity: 856.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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