Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-BMP6-106:73
Sequence Length
713 nt
GC Content
0.5231
AGAGACGCUAGGCCGGCACUGCCUAGGUGGGCCGGGCGGUGCGAGGGUCGCCUUUCAGCCUUUACCUCUACCCACUGAAAUGGAGUAGGUCGGUGAGCGCCGAUCUGCUGGAGAAUCUCAUUAUCCCAUCGGCGCUCUGCCUGCUCCUGGCCUCCAAGCCUCUGAAGCCCCUCGGGUUUCAGCUGCCGGCUACCCUCGAGCCCGUGGUGCCCACGAGAGAGGCGACUUUACGUCAGCGGCCCUGGGCUGAGAUUUGAGAACGCGACCAAGUGGAGAAUGUUGGAGCCAGAUUUUAAAAUCCUUGUCUUCCUUCUGCGUGCUACUUGAUCUAAAUGAGAUACGGCAAAGUCACAGAACCUGUUUUUAUGUUUUUGCCUGAUUCAUACGGGCUUCUCCGGUGAAGAUGGGCCUGAAGUAACGCUUGGGUUGCUUCUGACGUUAUAACUCAUCCUGUAGCUGCAGCAACCGUGGUCCUUGCAACCUCAUAAAAAUGUUGCCAGCAUUGUUUCGAUAGUGCUGCUUAAUUCUUGGAAGGCCUCUUUGCUUUCUUCCCUGAGGUUCUUCGGACUUCACACAUUCCAGCAGUAGCUCUCUCAGCUCCUGUCCUGCACAGCUUUGAAGUGCUGGUGAUGUCAUUGAACUCUUAAGUGCAAGAUGAAACAAGUCUUUCUGGGGUUCUAAGUAGGACACAGCCCUGGUGAUGGCUUUCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-248.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -260.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 181.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((.(((((((((((((.((....))))))))))).((((((((.((((((................)))))).(((((((((....((((((((((.....(((...........))).)))))))))).)))))))))..((((((..((..(((((((((...)))))))))..)).((((.......))))(((((...))))).).)))))(((.....))).))))))))((((((.((.((((((..((((.(((((((...((((.((((..((((............))))..)))).)))).))))))).))...(((((.((.(((...((((.....(((((((((((......(((((.......))))).......)))))))))))...((((((((......))))))))))))))).)).)))))......(((((.......(((((((....(((((((..........((.((((((((....)))))))))).........(((((((......)))))))....)))))))....))))..)))........))))).))..)))))).)).((((((((.((((........))))(((....))).(((((((..((...(((((.......))))).)))))))))...))))))))))))))))))..)))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((((.(((((((((((({.({....))})))))))},((((((((,((((((................)))))}.((((((((,{,..((((((((({.....(((,,......,..))),)))))))))),))))))))).,(({{{,..((..(((((((((...)))))))))..)).((((.,....,))))(((((...))))).},))))){{{.....))).)))))))}((((((.((.{(((((.,((.,,,,,|({(,{.{(((.((((..((((......,,,...)})).,}}}|{|||.{||||,,|{{,...,{(((.{{.((({,,{,((.{{,,,{{{{||||,|}.,}},|||{{.|||||.|||||...,},,}))))}}}})),,.((((((((......)))))))),}}}|}}.},.)))))}..)))))}}))).,...({(((((..,.(((((((....,,,...(,{((((((((....)))))))))}...},,...(((((((......)))))))....)))))))....))))}.)}},,.}}})}}},}}.)),,)))))).)).((((((((.((((........)))){{{....}}}.(((((((..{(...(((((.......))))).)))))))))...))))))))))))))})))..)))))))))...
Back