Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CCNB1IP1-1:3
Sequence Length
333 nt
GC Content
0.6456
GGCGGAGGGAAGCUCAUCAGUGGGGCCACGAGCUGAGUGCGUCCUGUCACUCCACUCCCAUGUCCCUUGGGAAGGUCUGAGACUAGGGCCAGAGGCGGCCCUAACAGGGCUCUCCCUGAGCUUCGGGGAGGUGAGUUCCCAGAGAACGGGGCUCCGCGCGAGGUCAGACUGGGCAGGAGAUGCCGUGGACCCCGCCCUUCGGGGAGGGGCCCGGCGGAUGCCUCCUUUGCCGGAGCUUGGAACAGACUCACGGCCAGCGAAGUGAGUUCAAUGGCUGAGGUGAGGUACCCCGCAGGGGACCUCAUAACCCAAUUCAGACUACUCUCCUCCGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-162.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -166.95
Frequency: 0.0005
Diversity: 64.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((....(((....))))))))((((((.....).)))))...(((((.......))))).(((((((...(((((((......)))))))...(((..((((((((...))))))))((((((((((.......)))((((((.((((((.......(((((.....(((((.((.((((.(((....))).)))))))))))..))))).))))))))))))........)))))))(((((..(((.....)))..)))))...(((((((.((((...)))))))))))..)))...)))))))..)).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((({(((((....({(,,,,}}}|||}}((((({,...,).)))))..,|((({.,...,.))))}.(((((((,..(((((((......)))))))...|||,,((((((({...)))))))){{{{((({{{......,.|(((((((.((((((.......(((((.....(((((.((.((((.(((....))).)))))))))))..)))))))))))))))))))},}....}})}}}|(((((..(((.....)))..)))))}..(((((((.((((...)))))))))))..))}..,)))))))..}},))))))))
Back