Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CMBL-1:9
Sequence Length
3337 nt
GC Content
0.4507
ACUGUCGGUCGGCGGCUAAGGAGGGGAGGCACCUGCAUCUGGGGCGCGGCGAAUCCUCGCGUGCGCCAGGCCGCCUGGGGUAGUCGCCGAGACUGCGCCGGCCAGCGGGGCCGAAACCUAAUCAGGAGCUGAGCUUUGAUGGCGGCUUCUGGAGGGACAAAGAAGGCGCAGAGCGGUGGGAGGAGGCUGCGAGAACCUAGCUCCCGCCCCAGCCGACGUGCGAGACAAAGGCCCCGGCGCGGGGCUCUUCGGAAGGCCGGGAGGUUCCUGUGACAAUGCGAGUCUGCGCCCCACGCUCCCGCACCGUGAUGCCGAGGCCAAAUGGCUAGAGUGGGCCCAGGCAUCAGCAUUUCUGUUUGGCAGCCGGGCAGUUGUGGUGCACGUUUUGAGGAACUACUAAAGCCUGCCUGUGAUGAAAAAGGCAAAAGCUGACUUCACCAAAAUUACUCCCAGGGAGACUUCUGCAUUUGGCUGGAAGGACAUUUGAGUAAACCGCUGAGGCUGGUGGUUGAAACAUAAUCCUCUAAGGGAGAUCGGUUCCGAUACCCUGAGUUAGGGACGCUUGCCUGGGCAGAGCUAAGGGGAGAAUGAUCAAAAGCCAAGCUCUGUCCCCGUCAGCACGUCACCCUCCCUCACUGUAAUCCCUGACUGUUUUCUCUAAAUGAAGAAUUAUUUAGAGAAUAUAAAUUAGAAGGGCCGCCACGUCAGAAUUGCCUGAGUGGGAGCAGUCUUUCCAGCCUCGAAAAAUGUUUAAACAAUAUGCAGAUGACCUAGCACAAAUAAAGAAUGCUAGCAACCGCUGUUAUGUGUGAGCGGUGGAAUUGGGAGGGCUCUUCCCCCAAUCUUCAUCAAACAGAGUAAGGUUUAGAAUAAAAAUAAUGAAAUACAGUCUUUCAAAAAGAGCAGCGCUUGACUAAUGUUACUGAUGUCACUCAUGUUACUCAAGGGAGGAAAGAACUCAAACUCUACAUAAUAAUACCCACUGAUUUCAAGGGCUGGCACGGAGAAUUAAGCAGACCGCCAUUCUUUAUAUUUGUUUUUUUGUUGUUGUUUGCUUAUGAUUUUUUUCUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAAGGGGUCUCGCACUGUCACCCAGGCAGGAAUGCAGUGGCGCGAUAAUGGCUCACUGCAAUCUCACUAUAUUGACCAGUAUGAUUUUCAACUCCUGUCUUUAAGCGAUCCUCACGCUUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGGUUACAGACAUGUGCCACUAUGCCCUGCCUAAAUAUGUUUAUAUAUACUACCGCCAAAGAAACAAUUUGAAGACGAUCUUUCCCCAGCCCCUCUCCUUCUGAUCCAACUCCAAGAGCUCACCCUCCCUGUAAGACCUGUAGCAGAGCACGUAUUGGCCUGCUGAUACUAGGGGCAAAGACCGGGCCGAUCAGAUGUUACAUGGCAUAAGGGCGAAGGAUUCUGAAAGAAAGACUGAGACUUGCUGGAGGAAGUACUAGUAGUGCCAAGGGCAGGAACUCAACUGUUAGGCAGAAGGGAGGAAUGUACUGUUGAUAUGGACAGACUCCAAGAAGGGGAGGGACUGCUGGGACUACUAGAACGAGAAUGCCUCUGCCCCUAUGGCUCAGCUCUGCAACUCUCUCUGCACAUUGGCUUCAUGCUGUUAGACCAGCUUCCUCCAUAUGUCUGGAAACAAGGCCACUGACAGCUCCCAACAUUUCAUCUUCUGCCUCAUCAUCAGACAGGCGAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAAGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUCCAGUGAUCCGUCCGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGAUUACAGGCAUGAGCCACCAUGCCUGGCCUACCAGGCCAAAAUCUAAGGACAAGAGAGAAUACCAAAAAGUAAAUGGAACAUGAAGGCUGCUUUUGUUUUGCUGAACCAGGCAAACUUGAACUUCUAUUUGACAGUUUCUAGCAGCAAAAAGGACGACUGUCAAAGCCCAGAGCCUGCCCAAGGGAAGGCAUCUGUUAAGAGACCUUCCACCAGGAGCCUCGCCCAAGACCCACACAGCUGCUCUCUCAGGGGAAUGGUGAACCAAGUAAAUCUGACUUCUCCUGGAGACUUUUAGGAAACUUAUCUGAGCCUUAUUUUUUAAAAGUUCCAGAAAAGUUAUGGCCAUGAAUCAGCCCUGGCAUAGACUGUACCCCAAAUUCAUACCCUAGUGAUCCAAUAAUCUUAAGCAGUGAGUUUAGUUUGAUGUAAUCUUGGACUGCUGGGACCCCCUAAGCACCUGGCAAAAGCAAACACAAAUUCUCUGUGGAAGAAUAUACCUGUGUGCUACUCAUUGUCCCUAGAAAUUUAUUUGUGGAGAUUCUUUGACAGAUAGAUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGACAACACACACGUAGCACAAGAACUAACACACAACAGGUAGCAGAAACCAUCCACAAAGACCUCAGGUAUGGAAGUUAGCAAACACAGAUUAUAAAGCUACUACACUAUGACUAUUUAAAAAAGAGUAAUGAAACAAUUUUAUUUUAAAAUCUCAAUUUUUAAACUGGAAUUACAUCUUUUGCCACCAUUUAAACAUAAAAUAUAAAAUUGUAUUCAUCAAGAAAUGAGGAUAUGCAAUGCAUAAUUUUUAGGUUACAUGCAAGCAAAAUCUUCAGAGAACCCUGCACUUUUCCAUGGGCAAGGGCACGGCUGUCCUUAGGCAUGUGAGAGUCUGCGGCCUGUGGCUUCCCAAUGGCAGAGGCCUCAUUUCAUGUACUGAUGUAUCCCUAAGGCCAACACAGGGCUUGACACAUAGUAGGGUGUCACUAAAUUUUGGCUGAAUGAGUAAUGUAUGAUUUUCCAGGAGAUACUUUAUGUCACUGAAAUAGCAACAUGUGUGUGAAUGCUUUUCUUAGGAAAAGACAAAUUCAUACCAUAGCUGAAAAAUCAAUCCAGUAACAAACAUACAUUAGGGUUAGUGUGUCUAUGCUCUUACAUCGGGAUUUCUUGGUUAUAAUGAAUUCAUUUUCAGUACUUCAUGCAGAUAUGCUCAACAGUGAUAUACACCGAGUUAAAUCAAAUAAUCAAAAUAGAGCACCAUGUAUUUCUUAUACAAUAUUCACAUAAAAAUUACUUACAAUUUAACCCAGAUUGUCACUAAAAUGAAGGCCUUGAAGACCAGUUGUUCUUUUCUCCAAACUUUUGUUAUAAACAUUUUGAAAUAUUCAGAAAAGUUAAAGGAUUCAUAUAAUGAACACCUGCAUGCCCAACCUAGAUUCAACAAUUGUUAAUAUUUAGCCAUAUUUAUUUUAAUGAUAUCAUUCCUUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-996.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1063.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 884.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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