Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CNBD1-4:11
Sequence Length
4997 nt
GC Content
0.3896
ACACACAGAGACACACCGCGACACACACACACACACGCGCGCAUACACACAGCCCGACACACACGCACGCGCGCUUCUUAAAGGAGACGGCUCAUAAAGGAUUCCCCACUACGCCAGCAGAGGGGAAGAGGAGCCCACGGGAAAGAAAAGCAGGCGAGGUUAAGAAUAAAGAGUGUUCCAGGAUAGCACAGAAGCAGAGACUUUAAGUCUAAACAGACCUAGAUUCAGAGCCGACCCGAUGCUGCUUGAAGAAGGCUGGAGGUAUGUUAAGGAGACAAGGGCUGUCAAGAAGCAGGGAUGUCUCUGGAAAGGUUCCCCUUGCUGCUGCCAUGUGAAGAAGGACAUGUUUGCUUCCCCUUCUGCCAUCAUUGUUAUUCAUGUUAGGCUCCUGAAAACACCACAAGGACCUACCCUCCGGGAGCCAGCCAGAGAACCCUUCUUCCUGCACUGUCUCCGUUAUGCCCAACAUUUCUGGGCAUAAGUUUUAAUAAACCUUACCUGGGAAAAGUUUGUUUGGCCUCGUGUUAAUUGCUAUUAUAUGGAGAGCCAAGAAUCUCGAACCAGUAAGAGUUGUGAAGUCACCCUCAAUAUUUCCCAAGUCUUCAAAGGAAUUGAGACACUAUAAUCAUUACCCAGGACUCCACGCUUGUCAAAUUUGUUGAUGACCUCCUACUUUGCAACCAAACUGAAUAGAAUGCUUGUAUAGACUCCCUAAUCCUUCUGAAGGUACUGACUGAGCAAGGCUACAAAGCCUCCAAAUCUAAAUGUCCAUGGGUACAGACAACUGACUUAUUUAGGCCAUAAAGCAUCUCGGAGCACUAAAAAACUCACAGUAAAAUAUCUUGAAGGAAUUUUGACAAUCUUUUCUUAAGAAGAAAGAAAAAAAACCAGAAAUUUUUAGAGGCAGCUGGUUAUUGCCAUCAAUGGAUUCUUAAUUUUGCCAUCCUAGCCAAGCCUUUAUAUGUUUUCCUCUCAGGUAUAACCUCAGAACCCCUUUUAUGGCCCUCUGAGACACUGGCCUCCUUUGAAGCAUUAAAAUAAGCAUUAUCUACACCCCCAGCUCUCAGUUUAUCCAAUUUUGACAAACCUUUUCAACAAUAUUGCCAUGAAAUUAAUGAGAUUGUUGCUAGUAUUCUAGAACAGCCGUUUGUCUCUCAAUUACUUUUUAUGGCAUAUUUCUUAUUUCGAUCAACCCUGUGACAUCAGGCAUGCCUCCAUGCCUGUGUGCGAAAGCCACAGCUGCCACCCUAAUGGAAAAAGCCUUUAUUCUUACAUUAGGCCUCCCUACUCACCUCUAUGUUACCCUUGAUGUGUCAGCGCUCUUACAAGCUCAUAAAACACAGCACCCUCUUUAUACAAUGGCAGACCACUGAUGAACAGGACCUAUUAACAAUUCUCUCUCUAUUGUAUCAUUGUAACACCCUGAACCGUGCUAUUCUAUUACUCCUCCUUGAUGAUGGACAGCCCAUUCUAUUCUACGUGAUUCCUUUGUAGCUAUAUAAAUGGUCUCAAAACUAUGAUUUUUUAGACAUCUUCUUAGACAGUCCAGACUUCUGUUUUGUCAUGGCUGUCAAGCAGAAUUCUCACCGAUACAUAGUAACUGACUGUGCCAUGGUUUCCUUAAAUGAAACACUUGAGACAAAUUCUGCCUUCUAUAUAAUCAGCCUGAACCACUGAGUCUAGAUCUUACACGAGCCUUGGCAAAGAGAAAACUGACACUAUUUACACUUGAGAUGUGCUUUGGACUCUGCCAUACUGUUGGCUGUAUUGAAAAGUCCCGUUUCUGACCUCUGCUGGUACCCCUAUUGCCAAUGGCCAUGUAAUUGUUAACCUAUUACGCCUAUUCAUCUUCUAAUUGAGGUUGCUUUUGUUUAUUGUUGGCACAUGCCAAGGAGACUGACACUGUAUCUCUGGUAGACAAUACGUCUGACAAAGCUGCCAAACAUGAACCCCCAACUCUGGCAAUAACCCAUUUUUUAACCCAGCUUACAACCCUGCCUUUAACACUUACUGACGUCAAUAAUAUUUGGCAGAUACCCUACAAUGAAAAAAAAGGCUGCAAGAAGAUUCCAGACAAUUGUUAGAAGGAUUAUACGUUGGACCAAAUGGACUUCCUAUAGUCCUUUAUCUUUUAUUGUUUUGUGCUUCUAUUUAUUGCCCAUCAAAUGGAAUAUAUGUGUAAAGAAGGGCAAAUCAAAGAGGUAAAUGACAGUGAUUUUGCCCUGGAAUCCACAGAAUUUCUGAUCAAAUUAUUUACCAAUGUAUUACUUGUAAAUCUUAUGAUAUUUCUGGAUGUAAGUAGCAUACCCCAUGAAAUCCUCUGAGACCCACAUUCCCUUUGCAACACUCCUGGUGGACUUUAUAGAUUUCCCUCAGGAUUCAGGUUAUUCUCAUUAUAGGUUGACUAUACCUAAUCUGAAAAUCCAAAAUCUGAAAUGAUACAAAUCCAAAACGUUAUGAGUGUUGUCAUAAUGCUCAAUGGAAAUGCUCAUGAAAGCAUUUUUUAUUUAAGGUCUUUGGAUUAAGGAUGCUCAUCCAGUAAAUAUGAUACAGCUAUUCCAGUGUCCAAAACUAUCCCAAAUCUGAAACACUUCUGGUCCCACCCAAGCAUUUCAGAUAAGGAAUACUCAACUCAUAAUUGGUGAUUACCUGCACAGUUAGUAGAUGGACUGAGUACUAUCCAACUAGACAUGCUGAUGCCACAUGGUAGUAAUGAAAAAAAAAAUUGAGAUUAUUCUUCAUUUUGGCAUUACUUAAUGUAUUAAAUCAGACCAAGGAACUCACUUAACAACAGAAGUAAAUCACAUGUUCACAAAAACUCUAGGAUAGUCAUUAAAAUUCUAUACUCUUUACCAUCCUCAGUCCUCAGAGAGGUGGAAUGUGAUAAUUUAGACAGCAAAAGAACUAUAAAAUAUGUCAGUACAAUAGACCUAAGUGGCCAGAAGCAUCACCCCUGACCCCAAUAAAAUCUGGAAAACCCCAAACAAGAGAGAUGGAUUAACUGCUUUUUGAAUAAUUUUUGAUAGCUUUAUGCCUAUUAGCAUCUCCAAACUUUUUGUUCCUGAAGUGAGUGAGCAUUAUGGGGACCUGAGUGAAAGGUUCAGUAUUAUGACUAGAUAUCUAAAAGAACUAUCUCUUGUACUUGGAGCUUACCAUUAACAGGCAAAAAAGUCAUGGCCAUUGUCUACCAACAAGCUUUCUAUCCCUUUUGACCAAGCUAUCAAGUAUACAUCAAAAUUUUGACAAGAAAGCAUACACUGUCAUCUUUCUGGGAAGUACCUUGUGAAGCAUUGCUGAACACCUACAUGGCCAUCAAAAUAAAAAGAAAUAUUUCCUGGAUUCAUGCAAGUCAUGCCAAGCUAGACCCAGAUCAUAAUUUCCAGAAAAAUUGAAAAGCUAUUCUUACAGCUGACUUCAAACCAAGGAUUUUCAGGGCCAAUUCACAGGGUCCCAAAGCAGAUGACAACAUAAAGUGGACUAUUUUUUCCAAUAUCUUGGAUCAAGAACUACCUUUCCACCUAUUUUCCCUUGAUAUCUUUCUCUUCUCUGACCAAAGGAAAAAAAAGUAAAUAAAAACCUUAAAAACCUCUUUGAGCUUUAAACAGAAACCUUCCCCUUUAUUUAUUGAUGGACUGUCUAGAGAUUGCUACUUUUUUCUUCUUCUGUUUCUUCACAAUGAGAUAUUUUCUAAACUGUGUCUUGCUUCAACUAACCCUUAUGGCUUUUUUUGACAAUUCUAGCAUAAAUCCAGCACCUACUCGCGCCAGUCUUCUAAACACUGGCAACUUUCAUCAAUCCGAAUUUUGGUUAUGUCAACAUAUCGGUAUACAGAAGAAGCUAACUAGUUUUUGUUUCUGCCAAUGCAAACACCUGGUGGACACAGACUGGACUAUGGAUGUACAAAAGGGUAUGGUAUCUACAAACAGGAAGACAAAAAUCAUGCCACCUCUCUUUCUGGUAAACUGAUUUGGCGCUUGGAAAAUUCCAUGGAAGCUCAAGUUCUAUUCUUUGUUCAGGUGAUGUUAUUGAAUGGACAAAUUUCCCUUUUCAUUGGAAACAGAAAUGGUACUGGACCCUUUCUAGAUCUCUUGCCUCACAGCUUCUAACCCAAAUCUUAUUUCUACAGCAACCAACACAGCUUCUCGUUUGUAAAACUUCUCAAGAUGUUUCAAAAUGGAAGAAAUACCAAAACCCACAAAGAAUCCUUGAGUUGGUAUGGUUAUUUUUAGUUGAGGACAUUUGAGAUUCCACAGAUGCAGAAAAGAAUCUUCUCAGAGCUUCCUUCUUCUGAUUAAAAGCAGCCACUUCUGGGAAAUAAGGCUGGCAUAAAUCCUCUCUUGAGAGUGGCUUUACUCCCAGAAACAAGACCAAGGGUAAAUCUACCAUAAAUCCCCUCUCCAGGGGAGUUUGAUGGCCAUAAAGAAGAUGAAAAGAGUUCUCACACCUGCAUAAACAAAUGUUAUCACAAACUUUCUUAUCUCUUGUUUGUUCUCCCAAAAAACUAUUUGUCUUUCCUAAAGAAAUCCAUUUGUUUUCCUUAUAGAAGUCUUUUCUCCCGGCUUGCUUCUCCUAUUAAGUUAGAUAUAUAAACUUCUAAUUUAACUUUUAGGAAACUACUUCUUUUGUAAGCUCUUGUAUGCAAAUAAACUGUUUUAUUCUCUUGUUAAUGUGUAUUUUCACAGCAUAUCCUCCACCCAGAUCCUGAAUUUGAGAGGGUAGAGGAAAAGUUUUCCUCUCCAACACUUUCGUUCUCUGUCAAUGGCUUCACUGGAUUGCUAGUCUUCCUAUUAAAAGCGGCAAUUUAUUCUUCCAAAGUUAGUUUCUAAAUAAUAUUCCAUAGAAUUUUCUUUUUAAAUAACCAGGUAAUACCUACGUUGACAUCAAGAGAGCACCAUGGUCAGUAAUUUUAAUACCCCAGGAACAUACUUUUAAGUAUACAUUGUUUUUCAACCAAUAUUGGAAAGGGAAAGUUCCAAACCAUACUAAUUGGACCUACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1168.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1266.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 1333.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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