Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CNBD1-4:16
Sequence Length
541 nt
GC Content
0.4344
ACAUUUGCAAGCAUAGCUGCACAUGUUCUGGUUUAAUUGGGAAAUCUCUCCUUUGACUUUCAGGAUAGCACAGAAGCAGAGACUUUAAGUCUAAACAGACCUAGAUUCAGAGCCGACCCGAUGCUGCUUGAAGAAGGCUGGAGGUUAUUCAUGUUAGGCUCCUGAAAACACCACAAGGACCUACCCUCCGGGAGCCAGCCAGAGAACCCUUCUUCCUGCACUGUCUCCGUUAUGCCCAACAUUUCUGGGCAUAAGUUUUAAUAAACCUUACCUGGGAAAAGUUUGUUUGGCCUCGUGUUAAUUGCUAUUAUAUGGAGAGCCAAGAAUCUCGAACCAGUAAGAGUUGUGAAGUCACCCUCAAUAUUUCCCAAGUCUUCAAAGGAAUUGAGACACUAUAAUCAUUACCCAGGACUCCACGCUUGUCAAAUUUGUUGAUGACCUCCUACUUUGCAACCAAACUGAAUAGAAUGCUUGUAUAGACUCCCUAAUCCUUCUGAAGGUACUGACUGAGCAAGGCUACAAAGCCUCCAAAUCUAAAUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-135.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -146.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 162.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((..(((..((.(((.((((((((.(((((..((((..((((((((((((((.(((((..(..(..(.(.((((.((((((........)))))).))))))..).)..)))))))))))).(((((((((...........((((.((((............)))))))).......((((.(((.(((.(((......))))))..))).)))).(((((((((.......)))))))))((((....))))....((((((.........(((((((((....((((....))))....))).))))))..((((((.((...((((.(((.(((((..........))))).))).))))....))..))))))..............)))))).))))).))))))))))...)..)).))..)))))..))).))))))))))..))).)))))))).....(((.(....((((...))))....)...)))..(((((....)))))........))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((((((((({{.||||,....(((((((,....{((((((((........((((((((({((({(,,{{(..({{({({((,,.|||||...,{{.{{|,,,||{||||{.{.......})}})))))},.|||}}|{,((((.{((..(((.((((((((...........|||......}}}.))))))))}}),,)}}}}})}},}}}}))),.)))))),,.(((((((((.......))))))))){{{{....}}}}(((({{(((....{(.,,.(((((((((,{{,{(((....))))}}}.))).)))))),,.}}....)))))))).})),})))))))........)))))))))((({{(({.....)))))))..............)))))}).....|||{{(((,....,|||}}}}........|},,,}},}}},,}}..,}}.}))})))),.,{.{{{.,....(({{...})))...,}...)))}.(((((....)))))........,))))}
Back