Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-CNBD1-4:6

Sequence Length

1469 nt

GC Content

0.3812

GUUCCCCUUGCUGCUGCCAUGUGAAGAAGGACAUGUUUGCUUCCCCUUCUGCCAUCAUUACGGAGUCUCACUCUGUUGCCCAGGAUGGAGUGCAGCGGCGAGAUCUCGGCUCACUGCAAGCUCUGCCUCCCGGGUUCACGCCAUUCUCCUGCCUCAGCCUUCUGAGUAGCUGGGACUACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCUAAUUUUAUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUCUCUAUCUCCUGACCUCUUGAUCUGCCCGCCUCCGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACAGCGCCCGGCCCAAAAAUCCAUUCUUAAUGGCUUUCUCUUCUGAUGCAAAAUCCUGAUUGCCUUCAAAUAUUACUAUUAGAUAGAAAUCUCCCCACCUUUAGCUGAAAGAGAUAAGGAGGUUUUGCACUGAGGAAACAAACAAACAAACAAGCAAACAACAUUCAUCAAUUUUUAAAAAAAGUAUGUAUUGAACUAUAGUCAGGUUCAAUGAGGAAAUGCAUUACAUUGUCACUAAACUGGCCUUAGUUGGAGAAAGAACACUGGCAGAUUAAUUAAAGUUAUUAGCGCUUAUGGUAGGAAACUGCAUGAUAUAUGUGAAAGAUCUUUUAGGGACUGGAAACACAGUGUAAAUUCAAACUCCUCCCAAAACUUUAACAAGGCUGGAUGAAAUGAAAGGAAUACUGUGAUUUCUACAAUUGACAACAGUGUCAGGCAUGCAGGAAACAAACAAAACCUUUUGAUGAAGGAAAAGUAACUUCUGGACAAAGUAUAAUUGGUUACAGGUAAACAGAUAUGUCAUCCAGGCAGAUAUGACAGUUUAUAGGAAAAAUAUAAUGUUAUGAUCUAAAAAAUGCAAGCCACAAACCUAUUGCCUGGGCAAUAAUUAGCCUGAAGUUGGGCUACUAAGGAGCUGGCUAAGCAGCAGUGAUAACACCAGAUACUGGAAGAAACUUCUGUGAUCAGAAACCAAUACAACUAGUGAACAAUUCACAGUAUUUCUAAAUCCGGGCACCAAGGAAGUUGUUUGGUUAGUCAUGAUGGAAGCCAGGAACAAAUAGAUCUCAAAUGUGUGAUAAUAAUUAUCAAGCGGAAUGUCUAGAAUAUUAUAGUGAGUGCCAAGAUUUCCAUCUAAGACAUUACCAACAUAGCAACUGAGGCAUGAAUUACAGGUUUUACACAAAAAAAGCAUUAUAAGAAUAAUACAUAUAAUAUAUUAACAGUUCAAAAGUGAAACAAACAUUUAUGAAUGGGCUACUCAGAUUUAAAAUAAAAUAUUGCCUGUUCAUUGAAUGCUUUCUGGAUUUUACUUUCUAAUUGUAUACCUCUCUUUCUUUCUUAAGAUAACUACUAUCAUAUAUUUGUUUUGGACUGCAUGUUAAUAAAAUUAUAUAAUAUGUAUUUUAUUAACUUCAUAAUAAAAAUACUUUUUAAAAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-349.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -378.44

Frequency: 0.0000

Diversity: 279.97

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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