Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:12
Sequence Length
597 nt
GC Content
0.4992
AGUCAUUCUUCUGGCAAACAUAUGUGGAAGGCCUCCGGGGUAGCACACCCUUCACCGUGCCCUGGAGAUGCUGGGAUGCGACAAAAAAGUAGGCUUCUCCCAUGAUGAACCUCACGGGUCCUUUCUCUGGCUGUGAUCCAUGCUUCUUCCCAGGGCAGGAUUACACUCUUUGAAUUUACUUAUUCAUCAAGACAGUGCAGAGUGGUGGAAAGAGAAGCAGCUGAGAGUUACGCAGUUGGAGGCAUCUGUCCACCCAUGUGGUUCCAGACACGUUCAUGUGGCCACCAUGACCCCGUCGGCAUCACAGGGGUAACCAAGAGAGCAGCAAGUUCCUGGGACAGAGGAGACAGAAGGGAAUUUCCAGGUUCUUCAGGACGUUCACAACCACACUGAGAAGCAUCUUUGCAGAUAAGUAUUUAAACUUACCAGCCCAUAGCCUACCAGCCUGCCCUCUUCUGGUCUGUGCAGGAAAGUGUAGUAUCCUAGAAUGCCAAAGUGGGAGGGGAAAUGGGUGAUGUAGCUCAUUCUCUUUUCUACCUCUAUGGAAGAAAGAAAGAGCCUGUCCCCAUUUUGUGGGGUCCCAGAAAGGGUGAUUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-192.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -206
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((.(.(((......))).).....((((((((((...............))))))))))...(((((((.(.(((((..(((..(((((((((.(((......))).)).(((...(((((((((((((((.(((((.......))))))))))))..(((((((((......)))))..)))).))).)))))....)))..))))))).))).........((((((((((((.(((((((((((.((((((.((.(((..(.(((((.(....)))))).)..))))).)))))).)))).....((.((((.....)))))).)))))))(((((..........))))).(.((((.(((................))))))).)......((.(.(((((......))))).).)).....)))).)))).))))(((((((((.(.((.(((....((.(......)))....))))).).)))))))))..(((((.((((..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).)))))))))))))).).))))))).)))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((((((((({({,..,...,}}||.,|||((((((((((...............))))))))))...(((((((,(.(({,...,{{..(((((((((.({{.{.,,,|}}.|||((({{{((((({{((((((((.(((({{,....,))))))))))))},(((((((((......)))))..}))}..,},}}))),||||||,|||}}}}|{|||{...,...,{({(((((((((.(((((((((((.((((((.((.(((..{.(((((.(....)))))).,..))))).)))))).))))...{.{(.((((.....))))))}))))))){{{{{.....,||,.,,))).|,|||,|{{(,..{{,....,,....))))))}{|,....}||.{.(((((......))))).}.}}.....)))).))))||))}(({((({((,{.{{.{{((({.,......,.))))....,)))).},})))))))),{(((((.(((,..((((.((((.(((((({......))))))).)))).)))).}))))))))))))),).))))))).})))))))),..
Back