Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:13
Sequence Length
579 nt
GC Content
0.4870
AGUCAUUCUUCUGGCAAACAUAUGUGGAAGGCCUCCGGGGUAGCACACCCUUCACCGUGCCCUGGAGAUGCUGGGAUGCGACAAAAAAGUAGGCUUCUCCCAUGAUGAACCUCACGGUUGGAGGCAUCUGUCCACCCAUGUGGUUCCAGACACGUUCAUGUGGCCACCAUGACCCCGUCGGCAUCACAGGGGUAACCAAGAGAGCAGCAAGUUCCUGGGACAGAGGAGACAGAAGGGAAUUUCCAGGUUCUUCAGGACGUUCACAACCACACUGAGAAGCAUCUUUGCAGAUAAGUAUUUAAACUUACCAGCCCAUAGCCUACCAGCCUGCCCUCUUCUGGUCUGUGCAGGAAAGUGUAGUAUCCUAGAAUGCCAAAGUGGGAGGGGAAAUGGGUGAUGUAGCUCAUUCUCUUUUCUACCUCUAUGGAAGAAAGAAAGAGCCUGUCCCCAUUUUGUGGGGUCCCAGAAAGGGUGAUUUUCACACUUCACAUUUGGCGUUAGGGCUAGUAUUUCACAAACAUUACCGUCUGGAACUUUUGAAGGCUGAGUUAAAUGACUUCAUCUUGUGUACUUGUAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-175.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -187.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 144.06
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((.((((((((....((((..((((((((((...............))))))))))...(((((((.(.(((((........((((((((((..((........((((((((((.(((((((((((.((((((.((.(((..(.(((((.(....)))))).)..))))).)))))).)))).....((.((((.....)))))).)))))))(((((..........))))).(.((((.(((................))))))).)......((.(.(((((......))))).).)).....)))).))))))(((.((.(((((.......))))).)).)))((((......))))))..))))))))))..(((((.((((..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).)))))))))))))).).))))))).(((.((((...)))).)))..((((((((....((.((.....(((.((.((......)).))))).......)).))..)))))))).))))....)))))..))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
........{((({{(({(((((.{,,((((..((((((((((..............,))))))))))...(((((((.(.((({,...{,,{{{((((({{,,,,,|,,}}},},((((((((((.(((((((((((.((((((.((.(((..{.(((((.(....)))))).,..))))).)))))).))))...,.{(.((((.....)))))),)))))))(({{{,.....,,..}}))).{.((({{(((...{{,...,,}....))))))}{|,....,||.{.(((((......))))).}.}}.....)))).)))))){,{{({{((((({,...,,{(||{.,.,}},.,.}})},,,,,}}))..}})))))))}{{(((((.(((,..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).}))))))))))))).).))))))).,{(,((({...}))).)))..{({(((((.,,,{{|{{{{...{((,{{.{{......}}.}))}}.,..,..}},))}})))})))).))))..,.)))))..})))))),
Back