Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:20
Sequence Length
596 nt
GC Content
0.5319
GCACCGGCCAGCUAGCCCCUUUGUGCGGCGGGGGCUGCGGAGUGCUCCCUCCAAGACCGGUUGCACCCCGCUUUCCUGGCCAGGACUCUGGGCGCGGUUGGAGGCAUCUGUCCACCCAUGUGGUUCCAGACACGUUCAUGUGGCCACCAUGACCCCGUCGGCAUCACAGGGGUAACCAAGGUCCACAGAACGAGGGGAAAGGGUCACUGUGGAUCAAGCCAGGCUCCUCUGAGCAGUCCAGGGUCUAUUUACAGAGAGCAGCAAGUUCCUGGGACAGAGGAGACAGAAGGGAAUUUCCAGGUUCUUCAGGACGUUCACAACCACACUGAGAAGCAUCUUUGCAGAUAAGUAUUUAAACUUACCAGCCCAUAGCCUACCAGCCUGCCCUCUUCUGGUCUGUGCAGGAAAGUGUAGUAUCCUAGAAUGCCAAAGUGGGAGGGGAAAUGGGUGAUGUAGCUCAUUCUCUUUUCUACCUCUAUGGAAGAAAGAAAGAGCCUGUCCCCAUUUUGUGGGGUCCCAGAAAGGGUGAUUUUCACACUUCACAUUUGGCGUUAGGGCUAGUAUUUCACAAACAUUACCGUCUGGAACUUUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-207.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -221.2
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((((((....(((((((.((..((..((((......)))).)).)).)))))))..(((((((((((((((((....(((((.((((((((((.(((((((((((......((((.....(((((.(((((((......(((((............)))))......)).))))))))))..))))..)))).(((.(((((...(((((......))).)).))))).))).......(((.((((.....))))))))))))))(((((..........))))).(.((((.(((................))))))).)......((.(.(((((......))))).).)).....)))).)))))))))))..))))))).....))))))))))...........(((((((((.((.((((.((((((((.((((..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).))))))))))))((((((((((......)).)).)))))).)))).))))))))))).))))))))..(((.((.((......)).))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,,{{,.((.(((((({..,,...|,))))))))){|{|,,,...}|||..|,}}|||,}},,..(((((((((((((((((....(((((.((((((((((.(((((((((({..||||{{((.,,,.(((((.((((({{.,,.,,(((((,,.{....,,}.)))))......)),))))))))))..,}},..}||}.{{(,((({{...{(({{{,,,,||||.}}.}||||,|}},......({{.{{((.....))))))))))))))||||,,....,{{..},))).{,{{{,{(((,..{{,....,}....)))))}}{|{....}||.{.(((((......))))).}.,),....)))).)))))))))))..))))))),....)))))))))){{{{..(((,.{((((((((((({(((,.{(((((((.(((,..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).,))))))))))}((((((((((......)).))}}))))).)))).)})))))))))})))})),}..,,,.,,.,,....||}},}))),.........
Back