Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:22
Sequence Length
590 nt
GC Content
0.5136
GCACCGGCCAGCUAGCCCCUUUGUGCGGCGGGGGCUGCGGAGUGCUCCCUCCAAGACCGGUUGCACCCCGCUUUCCUGGCCAGGACUCUGGGCGCGGGUCCACAGAACGAGGGGAAAGGGUCACUGUGGAUCAAGCCAGGCUCCUCUGAGCAGUCCAGGGUCUAUUUACAGAGAGCAGCAAGUUCCUGGGACAGAGGAGACAGAAGGGAAUUUCCAGGUUCUUCAGGACGUUCACAACCACACUGAGAAGCAUCUUUGCAGAUAAGUAUUUAAACUUACCAGCCCAUAGCCUACCAGCCUGCCCUCUUCUGGUCUGUGCAGGAAAGUGUAGUAUCCUAGAAUGCCAAAGUGGGAGGGGAAAUGGGUGAUGUAGCUCAUUCUCUUUUCUACCUCUAUGGAAGAAAGAAAGAGCCUGUCCCCAUUUUGUGGGGUCCCAGAAAGGGUGAUUUUCACACUUCACAUUUGGCGUUAGGGCUAGUAUUUCACAAACAUUACCGUCUGGAACUUUUGAAGGCUGAGUUAAAUGACUUCAUCUUGUGUACUUGUAGAACUGCUAUUAGAAGGAGGCUGGGGACUCCCUGAUGAUGUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-204.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -215.4
Frequency: 0.0000
Diversity: 106.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((......)))(((((((.((((.((((..((((.((((..((.........))..)))).))))..)))).))).(((((((((((((.(((((((((.((...........))..)))))))))..))...((((....)))).))))))))))).....(((.((((.....)))))))).)))))))...((..(((((.(((((((.((((((((.(.((((((((..((((......(((....)))((((((((..((.((((...(((((.........(((((((((((......)).....)))))...(((.((((((((..(((((((((.((.((((.((((((((.((((..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).))))))))))))((((((((((......)).)).)))))).)))).))))))))))).)))...))))).)))............))))..........))))))))).))..)))).)))).))))..)))).))))).))....))))))..))))))).)))))..))..))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(({.(((......)))(((((((.((((.((((..((((.((((..((.........))..)))).))))..)))).))).(((((((((((((.(((((((((.,{...........,)..)))))))))..))...((((....)))).))))))))))).....(((.((((.....)))))))).)))))))...((..(((((.(((((((.((((((((,{.((((((((..((((.{{{{.(((....))),{,{((((,,{{.,|||,,.(((((,..,{....(((((((((((......}}...,.)))))...{{{,{{({{(((,.{(((((((({(({((({.{(((((((.(((,..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).,))))))))))}((((((((((......)).))}}})))),)))).)}))))))))),))),},}}}}}.}}}..,,......,.}))),.....,,..)))))}))},})}}}))).,))),))))..)))).))))}.))....))))))).))))))).)))))..))..))}.
Back