Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:27
Sequence Length
568 nt
GC Content
0.5070
GUGCGGCGGGGGCUGCGGAGUGCUCCCUCCAAGACCGGUUGCACCCCGCUUUCCUGGCCAGGACUCUGGGCGCGGGUCCACAGAACGAGGGGAAAGGGUCACUGUGGAUCAAGCCAGGCUCCUCUGAGCAGUCCAGGGUCUAUUUACAGAGAGCAGCAAGUUCCUGGGACAGAGGAGACAGAAGGGAAUUUCCAGGUUCUUCAGGACGUUCACAACCACACUGAGAAGCAUCUUUGCAGAUAAGUAUUUAAACUUACCAGCCCAUAGCCUACCAGCCUGCCCUCUUCUGGUCUGUGCAGGAAAGUGUAGUAUCCUAGAAUGCCAAAGUGGGAGGGGAAAUGGGUGAUGUAGCUCAUUCUCUUUUCUACCUCUAUGGAAGAAAGAAAGAGCCUGUCCCCAUUUUGUGGGGUCCCAGAAAGGGUGAUUUUCACACUUCACAUUUGGCGUUAGGGCUAGUAUUUCACAAACAUUACCGUCUGGAACUUUUGAAGGCUGAGUUAAAUGACUUCAUCUUGUGUACUUGUAGAACUGCUAUUAGAAGGAGGCUGGGGACUCCCUGAUGAUGUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-191.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -202.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 129.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((.((((..((((.((((..((.........))..)))).))))..)))).))).(((((((((((((.(((((((((.((...........))..)))))))))..))...((((....)))).))))))))))).....(((.((((.....)))))))).))........((..(((((.(((((((.((((((((.(.((((((((..((((......(((....)))((((((((..((.((((...(((((.........(((((((((((......)).....)))))...(((.((((((((..(((((((((.((.((((.((((((((.((((..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).))))))))))))((((((((((......)).)).)))))).)))).))))))))))).)))...))))).)))............))))..........))))))))).))..)))).)))).))))..)))).))))).))....))))))..))))))).)))))..))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((.((((..((((.((((..((.........))..)))).))))..)))).))).{{{(((((((({{.(((((((((.,{...........,)..)))))))))..)),,,{(((,,,,}}}}.}}||}}}}}}}.....({{.{{{{.....)))))))).}),,,,,,,.((..(((((.(((((((.((((((((,{.((((((((..((((.{{{{.(((....))),{,{((((,,{{.,|||,,.(((((,..,{....(((((((((((......}}...,.)))))...{{{,{{({{(((,.{(((((((({(({((({.{(((((((.(((,..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).,))))))))))}((((((((((......)).))}}})))),)))).)}))))))))),))),},}}}}}.}}}..,,......,.}))),.....,,..)))))}))},})}}}))).,))),))))..)))).))))}.))....))))))).))))))).)))))..))......
Back