Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:41
Sequence Length
911 nt
GC Content
0.4951
AGUUCUGCGCUGUGAGCCGGGGCACAAAGAGCCCUCUGCACUAGCGCCGCAGGACCGCGGACCCGAGUUGGAGGCAUCUGUCCACCCAUGUGGUUCCAGACACGUUCAUGUGGCCACCAUGACCCCGUCGGCAUCACAGGGGUAACCAAGGUGAUCCUCCCUCUCUUCCUGUGUCCACUGGGGAUGGUAGAGACCAGCUUAAUGCUUUGAGAUCAGAUCCAUCACGAAAUCCGUAUGUCCUGAGACCUCCUGAAUCUUAAGAGAGCAGCAAGUUCCUGGGACAGAGGAGACAGAAGGGAAUUUCCAGGUUCUUCAGGACGUUCACAACCACACUGAGAAGCAUCUUUGCAGAUAAGUAUUUAAACUUACCAGCCCAUAGCCUACCAGCCUGCCCUCUUCUGGUCUGUGCAGGAAAGUGUAGUAUCCUAGAAUGCCAAAGUGGGAGGGGAAAUGGGUGAUGUAGCUCAUUCUCUUUUCUACCUCUAUGGAAGAAAGAAAGAGCCUGUCCCCAUUUUGUGGGGUCCCAGAAAGGGUGAUUUUCACACUUCACAUUUGGCGUUAGGGCUAGUAUUUCACAAACAUUACCGUCUGGAACUUUUGAAGGCUGAGUUAAAUGACUUCAUCUUGUGUACUUGUAGAACUGCUAUUAGAAGGAGGCUGGGGACUCCCUGAUGAUGUGAACCAGCCCUUCUCUUCUCAGUUUCAGCACUUUGUGAUCAUAUUUAUAAACCUUGGACAGGGCUCCUUGGCCUUAGAGUUAAGUGAAGAGUUAACACUGUGACUUUAGAUGCAUUUUUCUCAGUGUAAGUGUCUGAGCUCAUCUCCAGUUCUGGACUCGUGCCCCCACUCCCGGGUGCUGACAGCAAGCUCUGAAGAUAUGCUGAGAGAGCUCCCUGACUCUCCUGACUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-292.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -313.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 295.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((((..(((((.......))))))).))).)))))..(((((....(((...(((..((((((((((....((((.((((((.((.(((..(.(((((.(....)))))).)..))))).)))))).)))).....)))))..)))))..))).))).(.((((((((((((((((..((((..(((((.....((((((..((((.(((((((.....))).(((((.(((..(((((........)).)))((..((((..(((((((.(((((((..((((((......((.(((..(((((..((((.........(((.((((...)))).))).(((((......)))))...((.....))...(((((((.((.(((..((((.(.((((((...(((.((((((((..(((((((((.((.((((.((((((((.((((..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).))))))))))))((((((((((......)).)).)))))).)))).))))))))))).)))...))))).)))..........(((...(((((.........)))))....))).............)))))).)...))))..))).)))))))))))))..))))).))).))......))))))))))))).))))))).))))..))...............))))))))(((((....)))))((((((((((((.........)))).)))))))))))).)))).))))))..)))))))))..)).))))))))))...)))).)((((((........))))))...(((..((((((..((.....))...))))))..)))....)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,,.(((((((({(..(((((.......))))),,,)}).))))).|({({{..{{(((...(((..((((((((((,...((((.((((((.((.(((..{.(((((.(....)))))).,..))))).)))))).)))).....)))))..)))))..))).}}),|,((((((((((((((((..((((,{((,,...|||,{({({,,{{{,.,,|,(((.....))}{(((((((((,,(((((...((({,{{.((((.....))))))})))...))))}...,,,{((,...})}.,}}}},}))))))||.,......((((((((((((((({.,{{(({(((((,,{{.,|||||.{(((({..,{,,..(({{((({(((.,,,.,||.....}}|||,..{,{,{{{,|{{{..{{(((({{{{{{|{((|.{(((((((.(((,..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).}))))))))))|((((((((((.....,)).}}}}})))),)))),)})))))))))})))}},}}}}},|}|..,.......},}})),,....,,.,|}}}}||}|,}}|}}))},}}},.|||,...{{|.{{{(((..,..((((({,{(((((..(({{......)}.))...)))))))))))}}),,))))))}})}}}{{(((((......)))))}}.,,,,},.|{((({....)))))|(((((({((((.........)))).)))))))))))))....))))))))))..)}))))..)).)))))))))}..,)))).|||((|(,.......)))))).},(((,.((((({..{{.....))...))))))..|||,.{{,},,),.,,,,
Back