Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:53
Sequence Length
665 nt
GC Content
0.5083
AAGGCAGGAGGGGGCGUGCCCCUCACCGGAAAUUAGCAGAGGGGCGUGUCCCACACCGGAAGUCAGAAAGCGGAGCCUUUCUUACACCGGAAGUCAAUGAAGCGGGUCUUUCCUACGCUAAAAACCACUGAGUGGAGUAUUUAGUACACAGGAAGUCGGCCAGAGAAACAUUUCUCAUAUUUGAAGGCCGGAAAGAGGGACAUUUCUGACACCGGAAGUCAGUGAGAGGACUCUUUCCCACACAGGAAGUCAGCUAGAGAGCCGUCUCCCCUCUCUGGAGCCGAGAGAGGCCGGUUUCCCCCACCGUAGCCCACCUGGGAGGAAUUUUCCAGAGAUCACUGUCUGAUGACCCUGUCUUGGAAUUGGAGCCAUGCAAGUUACACUGACCACGUUUGGGUUGGGAUAUUGAGGAGGUUAUGGUUAAAAGCAUACGAUGGGAGAUCAUAUUGUACUUGCGAGUGAGACCCGGCUGGAGGAAUGUUUUAAUUCUUCGGAAAUACCAAGUGGUCUCUACAGAACACUGAAGAUUCUGCUCUCAGGGUGUUGAUUGACGUCUGGAAGGCAGAGACUCGUGGAUUAGCAAGCAUGUGUAAGAAAGUGCUCUGGAUGCCACAGGGUGGUAAUUUGUGCAUGGAAAAUGGCUGGGGUGAAGAGGAGACUAGGGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-221.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -233.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 137.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((((((((((((..(........)..))))))))))))))...((((..((.((((((......)))))).)).))))...........((((.((((((((..((((((..((((...))))....))))))....))))...(((((.(((((....))))).........)))))(((((((.....((.(((((.......))))).)).....)))))))((.....))..........)))).))))))))(((((((.(...).)))))))((((((((((.((((.(((((..((((((((((((((((.(((((((((((((....)))..((.(((..((((..((((.(.(..(.((..((((((.......))))))..)).)..).)))))..))))..)))))..((.((((...((((.((((....))))))))..))))..))(((((((......)))))))((.....)).))))))))))..........))))))))..)))))))).((((((((.(((((((.....))))....))).))))))))..((((((((((..(.(((((((.......))))))).)..))))))))))......))))).))))..).))))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((((((((((((((..(........)..))))))))))))))...((((..((,((((({.....,||||||,,}.||||...{,,,....{{{(,((((((((..((((((..((((...))))..,.))))))....))))},.,||||.(((((....)))))....,}},.}})))|{|||||,,.,.||}|||||.,,,,..}}}}}.||,.,,.)}}|||||,.....}},.,...,,,.}))),))})))))(((((((.{...).)))))))(((((((((,.((((.(((((..((((((((((((((((.(((((((((((((....))){{,,,{,{}},,{{..((((,{,(,,,.{{..((((((.,....}))))))..}}}),.,..})}}|||}}}..,,||}},,{.{(((...((({.((((....))))})))..)))}.,|.(((((((......))))))){{.....)).))))))))))..........))))))))..)))))))).((((((((.(((((((.....))))....))).))))))))..((((({((({..,.(((((((.......))))))).}..))))})))))......))))).))))..).))))))).))..
Back