Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:56
Sequence Length
658 nt
GC Content
0.4894
CAAUGAAGCGGGUCUUUCCUACGCUAAAAACCACUGAGUGGAGUAUUUAGUACACAGGAAGUCGGCCAGAGAAACAUUUCUCAUAUUUGAAGGCCGGAAAGAGGGACAUUUCUGACACCGGAAGUCAGUGAGAGGACUCUUUCCCACACAGGAAGUCAGCUAGAGAGCCGUCUCCCCUCUCUGGAGCCGAGAGAGGCCGGUUUCCCCCACCAUAGCAGGGCUGGGAGAAAGGGAUGGGGAGAGUCCCUCCUGCCACUGACCCAGGAUGGAUAAAAGUACCCCUUUCAUAGAAGGAAGAAAAUGGGAACAAAGGUGCUGCUGAUCAUCUGAGGUUGCCUGCAUGGCAGUGAAGAACAUGGACCUUUGGGUAGCCCACCUGGGAGGAAUUUUCCAGAGAUCACUGUCUGAUGACCCUGUCUUGGAAUUGGAGCCAUGCAAGUUACACUGACCACGUUUGGGUUGGGAUAUUGAGGAGGUUAUGGUUAAAAGCAUACGAUGGGAGAUCAUAUUGUACUUGCGAGUGAGACCCGGCUGGAGGAAUGUUUUAAUUCUUCGGAAAUACCAAGUGGUCUCUGUCUCACAUGAGUACUUCACAAUGGGGAAACUGAACUGGAACUCUACUGACAACGCAGUUGGGAGUUCAAACUUAAUAACCUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-203.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -217.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 205.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((((((((((((..((((((..((((...))))....))))))....))))))((((((.(((((....))))).........))))))..(((((..(((((((..((((((..(.(((.(((.((((((((.((((....(((.(.(.(((....))).).))))(((((((.(...).)))))))((..((((((...((......))...))))))..))..)))))))))))))))))))..)))(((..((((((.((..(((((((((((....))))).......((....))..))))))..)).))))))..)))((((.....))))))).)))).)))..)))))(((...)))..(((((((....)))))))(((.((..(((....)))..)))))(((........))).............)))).)))))..)))).........(((((((((((((....((((((((((........)))))))..)))..(((((((..((((.(((((((......)))))))((.....))....))))...))))))).(.(((.(((((...)))))..))).)....(((((((((((......))))..))))))).))))..)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{{.{{((((((({(((((..((((((..((((...))))..,.))))))....)))))},(((((.(((({....))))).........)))))|..{((({..{{((((({.(,,|||..|}|{{.({(.((((((|||(({{....((,,(.(.(((....))).).))))(((((((.{...}.))))))){(..((((((,..((......}),..)))})}.,})|.|))))))))))))))))}},,}}|(((..((((((.{{..(((((({((((,...}}})).......{(....)}..))))))..}}.))))))..)))|{{|,||,,))|}|||,||,},}||,,||||{(((,..}}},.{{{{{{|,...,})))}}{{{{{{,,{((,...))),,,|}}}|||,,,,,.,||}}}}}},|,....||||||.}}}}}.})))),........{((((((({{{{{....(({(((((((.,....}.)))))))..})){{{{((((({,{{{(.(((((((......))))))){|.....))..},)))))}.}}))),}.|,{{{.|{|||...,)))),,))).,....(((((((((((......))))..))))))).}})}..}))))))))
Back