Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:58
Sequence Length
584 nt
GC Content
0.4658
CUUUCCUACGCUAAAAACCACUGAGUGGAGUAUUUAGUACACAGGAAGUCGGCCAGAGAAACAUUUCUCAUAUUUGAAGGCCGGAAAGAGGGACAUUUCUGACACCGGAAGUCAGUGAGAGGACUCUUUCCCACACAGGAAGUCAGCUAGAGAGCCGUCUCCCCUCUCUGGAGCCGAGAGAGGCCGGUUUCCCCCACCACUCUCAGGGUAAAGAAGGAAAUGAGAAAUUGCAAGACAGAGUAUUUCUUAGGCAAUGGCUGAGAAUGGCAACUCACCACAUGCCUUUGAAUAAGACGUGAUUAUUAUUAACCCAUAUUCUAUCAAAGAAGAAACUGAGGCUCAGAGAGGCAACUUACUUGCCAAAGGUCACUCUGCUGGUAGCCCACCUGGGAGGAAUUUUCCAGAGAUCACUGUCUGAUGACCCUGUCUUGGAAUUGGAGCCAUGCAAGUUACACUGACCACGUUUGGGUUGGGAUAUUGAGGAGGUUAUGGUUAAAAGCAUACGAUGGGAGAUCAUAUUGUACUUGCGAGUGAGACCCGGCUGGAGGAAUGUUUUAAUUCUUCGGAAAUACCAAGUGGUCUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-165.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -178.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 146.3
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..((((((..((((...))))....))))))....)))))).(((((.(((((....))))).....(((...((((((((((.....((.(((((.......))))).)).....))))))))......))...)))(((....((((((..(((((((((..(.(((((((.((..((.....))..)).))))).)).)..)))...........((((.((((((((.((..(((..(((((.(((.((((........)))))))..)))))..)))..((((((((((..............((((........))))..((.(((((((((((....(((........)))....)))).)))..)))))).(((((((....))))))).)))))).))))....)).)))))))).))))...((...))....((..((((((.......))))))..))..)))).))..))))))...))).......(((...((((.((((....))))))))..))))))))(((((((......)))))))(((...(((....))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.,.{{....(((.{{((((((.((((...))))...(((((((((((.(((((....)))))....,{...,,{{((({(((({,...{{,(((((.......))))).||{,,,.||||||||......||,,|,,.{,,.||}))},,}))))}||||||,,..,},}})),)))))))))))....))))}),,}))))..,).)))))}.,...((((.((((((((.((..(((..(((((.(((.((((........)))))))..)))))..))}..((((((((((..............((((.....,,,)}},..{{.(((((((((((,,.,{{{..,,,,,.,}).,..)))).))),.))))},.(((((({....})))))).)))))).))))....}).)))))))).))))..{((({(((,,,,{{,.((((((.{....}))))))..,,,},.....}}||||}}}....{||||{{{{{,,...}},}}})))},,))),.,.((((((|,{{{.(((((((......)))))))||.....))..},)))))).
Back