Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:65
Sequence Length
775 nt
GC Content
0.4968
CUUUCCUACGCUAAAAACCACUGAGUGGAGUAUUUAGUACACAGGAAGUCGGCCAGAGAAACAUUUCUCAUAUUUGAAGGCCGGAAAGAGGGACAUUUCUGACACCGGAAGUCAGUGAGAGGACUCUUUCCCACACAGGAAGUCAGCUAGAGAGCCGUCUCCCCUCUCUGGAGCCGAGAGAGGCCGGUUUCCCCCACCGUAGCCCACCUGGGAGGAAUUUUCCAGAGAUCACUGUCUGAUGACCCUGUCUUGGAAUUGGAGCCAUGCAAGUUACACUGACCACGUUUGGGUUGGGAUAUUGAGGAGGUUAUGGUUAAAAGCAUACGAUGGGAGAUCAUAUUGUACUUGCGAGUGAGACCCGGCUGGAGGAAUGUUUUAAUUCUUCGGAAAUACCAAGUGGUCUCUGUCUCACAUGAGUACUUCACAAUGGGGAAACUGAACUGGAACUCUACUGACAACGCAGUUGGGAGUUCAAACUUAAUAACCUUCCAGAGUUGGUAUCAAAUUCAGACGCUGACGCUCCUUGGAGAGGUUCUUUGCUGCAAGAGGAUGGAAAGGAUCACUGUGAUUUUGUUUUUCUCCUGCUGCUCUGUCUGGAAGCCAUGUGAGGAGGACAUCUGAGCAGCCCUGUGGAGAGGCCCCCAGCCAACAGCCAGCAUGAACUUGCUGGGCAUGUGAGUGCACCACCUUGAAAGUAGAGCCUCAACCCCUGGUCAAGCCAUCAGGUAAGAUUGCAGCCCUGGCUUAUAUCUGACCACAACCUCAUGAGCAACCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-243.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -256.4
Frequency: 0.0000
Diversity: 182.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..((((((..((((...))))....))))))....))))))((((((.(((((....))))).........))))))...(((((((..(((((....))))))))...(((((....)))))(((...((((.((((((..((((....))))((..((((((((((......)))((((((((((.(((((((((..((((((((....)))))))...(((.(((((...(((((...(.(((...((..((.......))..))....))).)...))))).))))).))))..))))))))).....((((((((((........)))))))..)))..(((((((..((((.(((((((......)))))))((.....))....))))...))))))).(((.....)))....)))))))))).....(((((((((((......))))..)))))))..............)))))))..))..............))))))..))))))).((((((((..(((....((((.(((..(((((((...))))))).....(((((.((((((((((((....((...)).....)))))...))))))).....)))))(((.....))).....((((((......))))))((((....)))).)))))))...)))))))))))......(((((((((((...(((.........))).)))))......))))))...))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((((..((((((..((((...))))....))))))....)))))}{(((((.(((({....))))).........))))||{{{((({..,.{({((({{..,,,,.)))}}.|}{,{,.}}}})))|,.{{,((({.({((((.,((((,,,.||||(({,(((({(,{{|.,,,,,))}((((((((((.(((((((((..{(((((({....}))))))...(((.(((((...{((((.,.{.(((...{(.,{{.......}},.}}.,,,)}}.}...))))),))))).)))},.))))))))).....((((((((((......}.))))))}..})),,({((((({.{(((.(((((((......))))))){|.....))..,,))))}}.}})))}}.,|||.,,.,,,....)))))))))).....(((((((((((......))))..)))))))..............}}}}}}|,,}},.,,.......,,.))))))..)}}},)},||||||||,||||,,..{(((,{((,,(((((({...})))))}..,,,|||||,((((((((((((....,(,..,,..,,.)))))...))))))),,,},))})}(((.....))).....((((((......))))))((((....)))).}}}})))...)))))))))))......(((((((((((...(((.........))).)))))......))))))...}}}}...........
Back