Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-CRYBA4-52:66

Sequence Length

1021 nt

GC Content

0.5024

CUUUCCUACGCUAAAAACCACUGAGUGGAGUAUUUAGUACACAGGAAGUCGGCCAGAGAAACAUUUCUCAUAUUUGAAGGCCGGAAAGAGGGACAUUUCUGACACCGGAAGUCAGUGAGAGGACUCUUUCCCACACAGGAAGUCAGCUAGAGAGCCGUCUCCCCUCUCUGGAGCCGAGAGAGGCCGGUUUCCCCCACCGACAACAUCCAGAGGUGUCCAGAAAGAAGGUGGCCUUGACCAGAAUUCCUCAGCCUUGGCUGCACAUGAGAACCAGUGAGGGAGCCCUAAAAACGCUGAUGCCCAGGCUCCACCCAGACCUAUAGGUGCAGAACCUCUAGGGGAGGGCCCAGCCAUCGCGCUUUGAAAAAUCUCCUCAGGUCUCACAUGAGUACUUCACAAUGGGGAAACUGAACUGGAACUCUACUGACAACGCAGUUGGGAGUUCAAACUUAAUAACCUUCCAGAGUUGGUAUCAAAUUCAGACGCUGACGCUCCUUGGAGAGGUUCUUUGCUGCAAGAGGAUGGAAAGGAUCACUGUGAUUUUGUUUUUCUCCUGCUGCUCUGUCUGGAAGCCAUGUGAGGAGGACAUCUGAGCAGCCCUGUGGAGAGGCCCCCAGCCAACAGCCAGCAUGAACUUGCUGGGCAUGUGAGUGCACCACCUUGAAAGUAGAGCCUCAACCCCUGGUCAAGCCAUCAGGGAGAGCUCAAGCUGGCCUGUUGGAAGAUGACAGGCCAUAUGCAACAGACGUGAAGUGUCCCAGCUGAUCCCCUUCCAGAACACCCACCUUCCAGAUGACCACAGAUGCAAGGGUGAGCCAGCCAAUAGCUGCUGAGACAUUCCCAGAAAGACAGAACAUCCAGCUGACCCAUGGACUCAUGGGCGAUCAUGGAUAAAUGGAUAUUGUUUCAAGCUACUAGGUUUGGGGUUGGUUUGUUACGCAGCAAUAGCUAACAGCUACACCUCUAUUUUAAGGAGUUGUGAAGAUAAAUUGCAAAGGUACAGAAAAAUGAAUAGCUAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-325.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -343.8

Frequency: 0.0000

Diversity: 213.33

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((..((((((..((((...))))....))))))....))))))((((((.(((((....))))).........)))))).....((((((((((((((.......))))..(((....))).((((......))))(((((((...((((..((((((((.(((((.(((......)))((((.......))))...(((((....)))))))))).))..((((((.((((((((..(((((((.....((.(((.((((.(((((..(((((((......(((.(((.((((.(..(((((..((((((......(((.....)))))).)))..)))))..).))))))).)))......)).)))))))).)).)))).)))))......))))))).........(((((((((((......))))..)))))))..............((((((((.(((.((.......)).)))...))))..))))((((((((..(((....((((.(((..(((((((...))))))).....(((((.((((((((((((....((...)).....)))))...))))))).....)))))(((.....))).....((((((......))))))((((....)))).)))))))...))))))))))).....)))))))))))))).)))))))))).)))))))((((((.(..(((......))).).))))))....))))))))))(((((.((...(((.........((((((.((..((....))..))..))))))((((((((...(((((((((((((...(((............(((((..((.((((((....))))))))....)))))...)))....)))))).))).....))))...))))))))(((..(...(((((..((.((((((...(((........)))))))))..))....)))))...)..))))))....)).)))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{(((((..((((((..((((...))))..,.))))))....)))))},(((((.(((({....))))).........))))|{{,{{,({{{({((((((((.......))))}.||{.,..}})}}|||......||||{{(((((.,.((((..(((((({(,((((({(((......)))((((.......))))....,,||....)))}}}}}}}.,}..((((({{((((((((..{((((((.....{(,({(.{{(((({{((..(((((((......(((.(((.((((.{..(((((,.(((,,.,{{{.((((.....)))),)})))}.)))))..).))))))).)))......)).)))))))))))}.,)),))},,......)))))))..,,.....(((((((((((......))))..)))))))..............((((({(({(((.((.......)).)))}},}))}..})))((((((({.,(((....((((.(((..(((((((...})))))}.....(((((.((((((((((((....,(,..,,..,,.)))))...))))))).....)))))(((.....))).....((((((......))))))((((....)))).)))))))...))))))))))).....)))))))))))))).)))))))))).,|||(((((((((.....})))))))))...}}..,.|,,,.}}}}))))))|||||,||,,}}}},......,.({((((.((..((....))..))..)))))),{((((((..,(((((((((((((...(((............(((((..({.((((((....)))))),,..,.)))))...)))....))))))}}))...,.)))}...))))))}|(((..(...(((((..((.((((((...(((........)))))))))..))....)))))...)..)))},.....,,.,,}},....