Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-CRYBA4-52:69

Sequence Length

583 nt

GC Content

0.4648

UUUCCUACGCUAAAAACCACUGAGUGGAGUAUUUAGUACACAGGAAGUCGGCCAGAGAAACAUUUCUCAUAUUUGAAGGCCGGAAAGAGGGACAUUUCUGACACCGGAAGUCAGUGAGAGGACUCUUUCCCACACAGGAAGUCAGCUAGAGAGCCGUCUCCCCUCUCUGGAGCCGAGAGAGGCCGGUUUCCCCCACCACUCUCAGGGUAAAGAAGGAAAUGAGAAAUUGCAAGACAGAGUAUUUCUUAGGCAAUGGCUGAGAAUGGCAACUCACCACAUGCCUUUGAAUAAGACGUGAUUAUUAUUAACCCAUAUUCUAUCAAAGAAGAAACUGAGGCUCAGAGAGGCAACUUACUUGCCAAAGGUCACUCUGCUGGUAGCCCACCUGGGAGGAAUUUUCCAGAGAUCACUGUCUGAUGACCCUGUCUUGGAAUUGGAGCCAUGCAAGUUACACUGACCACGUUUGGGUUGGGAUAUUGAGGAGGUUAUGGUUAAAAGCAUACGAUGGGAGAUCAUAUUGUACUUGCGAGUGAGACCCGGCUGGAGGAAUGUUUUAAUUCUUCGGAAAUACCAAGUGGUCUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-165.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -178.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 147.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((..((((((..((((...))))....))))))....)))))).(((((.(((((....))))).....(((...((((((((((.....((.(((((.......))))).)).....))))))))......))...)))(((....((((((..(((((((((..(.(((((((.((..((.....))..)).))))).)).)..)))...........((((.((((((((.((..(((..(((((.(((.((((........)))))))..)))))..)))..((((((((((..............((((........))))..((.(((((((((((....(((........)))....)))).)))..)))))).(((((((....))))))).)))))).))))....)).)))))))).))))...((...))....((..((((((.......))))))..))..)))).))..))))))...))).......(((...((((.((((....))))))))..))))))))(((((((......)))))))(((...(((....))).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{(((((.,.{{....(((.{{((((((.((((...))))...(((((((((((.(((((....)))))....,{...,,{{((({(((({,...{{,(((((.......))))).||{,,,.||||||||......||,,|,,.{,,.||}))},,}))))}||||||,,..,},}})),)))))))))))....))))}),,}))))..,).)))))}.....((((.((((((((.((..(((..(((((.(((.((((........)))))))..)))))..))}..((((((((((..............((((.....,,,)}},..{{.(((((((((((,,.,{{{..,,,,,.,}).,..)))).))),.))))},.(((((({....})))))).)))))).))))....}).)))))))).))))..{((({({(,,,,{{,.((((((.{....}))))))..,,,},.....}}||||}}}....,||||{{{{{,,...|},}}})))},,))),.,,{{{{{{|,{{{.(((((((......)))))))||.....})..},)))))).