Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-CRYBA4-52:88
Sequence Length
595 nt
GC Content
0.4958
AGGGAAGCCAUGUGAGGAGGACAUCUGAGCAGCCCUGUGGAGAGGCCCCCAGCCAACAGCCAGCAUGAACUUGCUGGGCAUGUGAGUGCACCACCUUGAAAGUAGAGCCUCAACCCCUGGUCAAGCCAUCAGGGAGAGCUCAAGCUGGCCUGUUGGAAGAUGACAGGCCAUAUGCAACAGACGUGAAGUGUCCCAGCUGAUCCCCUUCCAGAACACCCACCUUCCAGAUGACCACAGAUGCAAGGGUGAGCCAGCCAAUAGCUGCUGAGACAUUCCCAGAAAGACAGAACAUCCAGCUGACCCAUGGACUCAUGGGCGAUCAUGGAUAAAUGGAUAUUGUUUCAAGCUACUAGGUUUGGGGUUGGUUUGUUACGCAGCAAUAGCUAACAGCUACACCUCUAUUUUAAGGAGUUGUGAAGAUAAAUUGCAAAGGUACAGAAAAAUGAAUAGCUAUAACAGCUACUAGUGAUUGAGUGCUGGCUCUGCCUGGUACUGUGCUCAGGAUUGGCAUGCAUUAUCUCAAAGAGUUGCACAGGCUAGAAGGGCUGCAGCUGAAGAUUCUAGAAGAGUUCAGGUAUAAUGCCUGGCACAUGGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-192.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -203.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 143.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((....(((((((((.(..(((((....)).)))..)))).......((((((......)))))).(((((..(((((..............((((.((...(((((((......))))))).))))))....((((((((((.....))))))))))..))).))..)))))..))))))((((((...((((((.........((((((.((..((....))..))..)))))).(((((((...(((((((((((((...(((............(((((..((.((((((....))))))))....)))))...)))....)))))).))).....))))...)))))))((((..(...(((((..((.((((((...(((........)))))))))..))....)))))...)..)))).........(((((....(((((.((..(((...(((((..(((...(((((((...))).))))...)))..)))))...))).)))))))....)))))))))))...))))))..((((((...))))))((((((...)))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((((....((((({((,.({.{,,(({{,.}}.|||...,,}||.,,,,((((((......)))))){(((,,..||||.,,,.......,|,.((({{((...(((((((......))))))).))))))..}}|((((((((|.....})))))))),..}}),,),,,,)),.,))))))((((((...((((((.,{......,....(((...(((.(((((.(((.,(({{((((((((({{{,(((({(((((((...(({............(((((..({.((((((....)))))),,..,.)))))...)))....))))))}|)){,{{{|,,,,|{|((({{{(((({,,,,.{{,,,.}||}||||||}.}|||}.......,}}}}||||..,,....,))})...},,}|},,....,...(((((.....))))),}})).}}}}.,.)))))))).,))).)))))))).)))))).|||{.((((...(((...}))..))))...})),))))))...))))))..((((((...))))))((((((...)))))).))))))))
Back