Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-CRYBA4-52:9

Sequence Length

579 nt

GC Content

0.4870

AGUCAUUCUUCUGGCAAACAUAUGUGGAAGGCCUCCGGGGUAGCACACCCUUCACCGUGCCCUGGAGAUGCUGGGAUGCGACAAAAAAGUAGGCUUCUCCCAUGAUGAACCUCACGGUUGGAGGCAUCUGUCCACCCAUGUGGUUCCAGACACGUUCAUGUGGCCACCAUGACCCCGUCGGCAUCACAGGGGUAACCAAGAGAGCAGCAAGUUCCUGGGACAGAGGAGACAGAAGGGAAUUUCCAGGUUCUUCAGGACGUUCACAACCACACUGAGAAGCAUCUUUGCAGAUAAGUAUUUAAACUUACCAGCCCAUAGCCUACCAGCCUGCCCUCUUCUGGUCUGUGCAGGAAAGUGUAGUAUCCUAGAAUGCCAAAGUGGGAGGGGAAAUGGGUGAUGUAGCUCAUUCUCUUUUCUACCUCUAUGGAAGAAAGAAAGAGCCUGUCCCCAUUUUGUGGGGUCCCAGAAAGGGUGAUUUUCACACUUCACAUUUGGCGUUAGGGCUAGUAUUUCACAAACAUUACCGUCUGGAACUUUUGAAGGCUGAGUUAAAUGACUUCAUCUUGUGUACUUGUAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-175.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -187.97

Frequency: 0.0000

Diversity: 144.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.........((((.((((((((....((((..((((((((((...............))))))))))...(((((((.(.(((((........((((((((((..((........((((((((((.(((((((((((.((((((.((.(((..(.(((((.(....)))))).)..))))).)))))).)))).....((.((((.....)))))).)))))))(((((..........))))).(.((((.(((................))))))).)......((.(.(((((......))))).).)).....)))).))))))(((.((.(((((.......))))).)).)))((((......))))))..))))))))))..(((((.((((..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).)))))))))))))).).))))))).(((.((((...)))).)))..((((((((....((.((.....(((.((.((......)).))))).......)).))..)))))))).))))....)))))..))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

........{((({{(({(((((.{,,((((..((((((((((..............,))))))))))...(((((((.(.((({,...{,,{{{((((({{,,,,,|,,}}},},((((((((((.(((((((((((.((((((.((.(((..{.(((((.(....)))))).,..))))).)))))).))))...,.{(.((((.....)))))),)))))))(({{{,.....,,..}}))).{.((({{(((...{{,...,,}....))))))}{|,....,||.{.(((((......))))).}.}}.....)))).)))))){,{{({{((((({,...,,{(||{.,.,}},.,.}})},,,,,}}))..}})))))))}{{(((((.(((,..((((.((((.(((((((......))))))).)))).)))).}))))))))))))).).))))))).,{(,((({...}))).)))..{({(((((.,,,{{|{{{{...{((,{{.{{......}}.}))}}.,..,..}},))}})))})))).))))..,.)))))..})))))),