Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DAD1-2:17
Sequence Length
667 nt
GC Content
0.4708
GAGUGAUCACAGUUUUUGAGAAUCAUGAUGAGGCAUUAAAGAAGAGGAGGAGUGUCUCAAGGGAGGUGAGCUGGAGGUGAUGCAAGGAUGUCUGAUCUGAAAGCAUGUUGUGGUCCGCUACACACAAGAGCAAAAGAAGAGCAGGAAGGAGCUCAGUGCCAAGACCAUAGCCACAGGAAGAAAACCAGCUCUUAGGGCUGCAGCUCUAAAGACAGGCCAGGUCAUUACAGGAACGUCUGCUCCCUUAGCCUUGCCAGACAGAGGAGGGUUAAGAAAGGAACUGCUGACCCUGAUAUGCAAACUGCCACGAGUGCUUCCUGCCUUUCUAUCAGCAUCAGAUGGCUAGCGAUGGAUGGCUGUAAGAUUGAUGUAAUUAACAUUUUAUUUUCAGGGCCACAGUGCUGGUUGGGUGCACCAGACAAAUCAACCAACAGAUUAAAGAGUGAUGGAGAAAGCUGUGUUUUGGGCCUCAUUUGGGAACAGAAUGGAAGAGCUGAGGGUGGAAGGGACCUCAGCAAGUCUUCUGAUCCAUGUUUCAACCUUCAUUUCCCCGAUAACCUCAAGGAGAGAGUUGCUUUUCCUGUUCUUCAAAUGAGUUCCUUGAAUUCACACUCUAUUUCUUUGAAUUUGCACAGACUGUUGAGGAACAGGCGGCAGGGUCACUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-212.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -223.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 111.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.(..((((((((.(((....(((((((((.............))))))))).(((((((((.....((((((.(((.(((((((((((((((..((.(.(((((..........))))).)))...(((((.((((((((..((((.(((.((.((((...(((......(((....((((((...))))))....))).......)))..))))....((((...(((.((((((((((((((.((.......)))))))))))...)))...)).)))))))..........)).))))))).)))))))).))))).)))).))))))).(((((((.((..(((((.((((((.(((((.....)))))..))))).).))))))).)))))))(((.....)))....((((........))))..(.(((..(....)..))).)((((((..(((.....)))..))))))(((((((((((((..........)))))))...)))))).)))).))).)).))))))))))))).)))...))))))))..)..(((((...((((((((((((...((((...((((((((.............))))))))....)))).)))))))))))).)))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.{..((((((((.{{{....(((((((((.............))))))))).(((((((((...,{((((((.(((.(((((((((((((((..((.(.((((({,.....,}.))))).)))...(((((.((((((((..((((.(((.,,.((((.,.(((...{{.,,....}|,{,(({{{||||,,..}}))),,,},..))).,))))....((((...(((.((((((((((((((.((.......)})))))))))...)))...)).)))))))....{,....))}))))))).)))))))).))))).)))).))))))),(((((({.({..(((((.((((((.(((((.....)))))..))))).).))))))).)))))))|(({.,{.|||{{{{..{{..{{{.{{,,,,......}}.}}}......,}.)||||||,,|||}.,,,|}}..))))}}(((((((((((((..........)))))))...)))))).)))).))).)),,)))))))))))).}}}...))))))))..}..{((((...((((((((((((...((((...,(((((({.............))))))),....)))).)))))))))))).))))}))))))))..
Back