Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DAD1-2:18
Sequence Length
588 nt
GC Content
0.4762
GAGUGAUCACAGUUUUUGAGAAUCAUGAUGAGGCAUUAAAGAAGAGGAGGAGUGUCUCAAGGGAGGUGAGCUGGAGGUGAUGCAAGGUGGAGAGAGGAUGCCAGACAGAUAUUUGAGCAGAACAAAGAGAGCCAACAGGAUGAAGGCAUUCCCUGGCUGGUUGGACAAGCAACUGAAGAACAGGAACAGAAGUGAAUGAAAAGAGAAGAUGCUGUGUUUGUGUUUUCUCUUGGUUAGAAUGCUGUGAGUCAGGACCUUAGCUGCUGGGUGUCCUGGGACUGCCUUCGAUGAAGAACCUGAGGCUCACCUUGCUUAAGUGACUUGAGCAGCUUCACGCAUCUUUCUGACAUUCCAGCAAUACCGGAGCAUUGACAGUUGAUAAUAGCUCUAUGUGCUACCUCUCCAAGAAACAAAUUUGCAUUUUAACCUGCCCCUUCAAUGGCUGAACUUCAAAGGGUCACUGAUGAAUGCCACAGCAGAGAAAACUGCAAAUUGGAACAGCAGAGCUGUGCCUCUGGCCAUUUCCUGGAACUACAGAGGAGCAACUUGCCCCGGUUUCCAGUGGGUGAUGUUCCUCUUCUGCCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-186.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -196.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 91.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((..((((....))))..))))((((((((.............))))))))..((((((((.(((((((((((((((((.(((((((.(((((.((((.((((...(((((..........(((((..((((.((((((((.((((((.(((((((......)))))..))..)))).((((..((...(((.((((((((((((.......))))))))))))..)))..)).))))...((((((((((((...))))).))))))))).))))))))........)))).)))))....((((((((...)))))))))).)))...)))).)))).))))).((((.....(((((((((........)))).)))))...))))..))))))).........)))))))).......(((........))).....((((..((....))..))))..(((..((((......))))....))).(((((...)))))))))))))))))))))).......((((((((.((((((((((........).)))))).))).)))))))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((({..{{{,.,,.)}}),,)}}|((((((((.............)))))))),.((((((((.((((((((({{((({{,.(((((((.(((((.((((.((((...(((((..........(((((..((((.((((((((.((((((.(((((((......)))))..})..)))).((((..,{...{,,.((((((((((((.......))))))))))))..}},..,,.))))...,(((((((((((...))))).))))))))).)))))))}........)))).)))))....((((((((...))))))))))}}))...)))).)))).)))))}((((.....(((((((((.,....,.)))).)))))...))))..))))))).........|}))}}}|.....,,(((..,,....|||....,{{{{.,||,.,.})..}))}.,|{{..((((......))))....)}}.(((((...)))))))))))))))))))))),,.....{(((((((,({{(((((((,{...}}.).)))))),))),)))))))).)}}..
Back