Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DAD1-2:21
Sequence Length
595 nt
GC Content
0.4908
GAGUGAUCACAGUUUUUGAGAAUCAUGAUGAGGCAUUAAAGAAGAGGAGGAGUGUCUCAAGGGAGGUGAGCUGGAGGUGAUGCAAGGAUGUCUGAUCUGAAAGCAUGUUGUGGUCCGCUACACACAAGAGCAAAAGAAGAGCAGGAAGGAGCUCAGUGCCAAGACCAUAGCCACAGGAAGAAAACCAGCUCUUAGGGCUGCAGCUCUAAAGACAGGCCAGGUCAUUACAGGAACGUCUGCUCCCUUAGCCUUGCCAGACAGAGGAGGGUUAAGAAAGGAACUGCUGACCCUGAUAUGCAAACUGCCACGAGUGCUUCCUGCCUUUCUAUCAGCAUCAGAUGGCUAGCGAUGGAUGGCUGUGGAGAGAGGAUGCCAGACAGAUAUUUGAGCAGAACAAAGAGAGCCAACAGGAUGAAGGCAUUCCCUGGCUGGUUGGACAAGCAACUGAAGAACAGGAACAGAAGUGAAUGAAAAGAGAAGAUGCUGUGUUUGUGUUUUCUCUUGGUUAGAAUGCUGUGAGUCAGGACCUUAGCUGCUGGGUGUCCUGGGACUGCCUUCGAUGAAGAACCUGAGGCUCACCUUGCUUAAGUGACUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-190.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -201.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.8
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((..((((....))))..))))((((((((.............))))))))(((.((((((((((..((((..(((..(((((((((.((((...(((((((((((((.(((.(......)))).......((((........))))........)))))))))..(((((((.....((.((((((((((....))))))).....(((.((..(((..((((...(((.((((((((((((((.((.......)))))))))))...)))...)).)))))))..)))....)))))..))))))))))))(((((((..(((((((..((.(....).)).))).))))...))))))))))))))))))))))))..)))............((....))..(((((((.((((((.(((((((......)))))..))..)))).((((..((...(((.((((((((((((.......))))))))))))..)))..)).))))...((((((((((((...))))).))))))))).)))))))........))))..)))))))))).))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{,.,(({{.,,,,.||,,.,}}},..|((((((((.............))))))))|((.((((((((((..((((..(((..(((((((((.((((...(({(,((((({{,.,,,.|.}}},..}}}....,,,{.((((((((..{(((.(((....((((.|.(((.,.((.{{....,|.{{(({((((((....)))))},,},..))).,))))....((((...(((.((((((((((((((.((.......)})))))))))...)))...)).)))))))..,.|,....))}))))))).)))))))){||||{,.{{(((((..,({{,...}.,,.)})}})))}}})})},},)))))))))))))))))..)))............((....)).,(((((((.((((((.(((((((......)))))..})..)))).((((..,{...{,,.((((((((((((.......))))))))))))..}},..,,.))))...,(((((((((((...))))).))))))))).))))))),.......))))..)))))))))).))}..}},},,.
Back