Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DAD1-2:26
Sequence Length
602 nt
GC Content
0.4934
GACAGCCUCAGACUCAGGGCUGGGACCCUUGGGACUCAAAAGAGAGAAAAGGUGGAGAAAAGAGAAAGCUACUAUUUUCUUCAUUUUGCCCCUGCUAACAUCCAAUGCACUUAGGAGCCUCGAUGUCUGCUCUCCAAGAGAUGUCUGAUCUGAAAGCAUGUUGUGGUCCGCUACACACAAGAGCAAAAGAAGAGCAGGAAGGAGCUCAGUGCCAAGACCAUAGCCACAGGAAGAAAACCAGCUCUUAGGGCUGCAGCUCUAAAGACAGGCCAGGUCAUUACAGGAACGUCUGCUCCCUUAGCCUUGCCAGACAGAGGAGGGUUAAGAAAGGAACUGCUGACCCUGAUAUGCAAACUGCCACGAGUGCUUCCUGCCUUUCUAUCAGCAUCAGAUGGCUAGCGAUGGAUGGCUGUGGAGAGAGGAUGCCAGACAGAUAUUUGAGCAGAACAAAGAGAGCCAACAGGAUGAAGGCAUUCCCUGGCUGGUUGGACAAGCAACUGAAGAACAGGAACAGAAGUGAAUGAAAAGAGAAGAUGCUGUGUUUGUGUUUUCUCUUGGUUAGAAUGCUGUGAGUCAGGACCUUAGCUGCUGGGUGUCCUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-189.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -201.4
Frequency: 0.0000
Diversity: 154.9
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((((((((((((..(((...(((((.....((.(..(((((((((((((.((.......)).)))))))))))))..).))(((..(((((...........(.(((((..(((((((((......(((((((((.((((...(((((((((((((.(((.(......)))).......((((........))))........)))))))))..(((((((.....((.((((((((((....))))))).....(((.((..(((..((((...(((.((((((((((((((.((.......)))))))))))...)))...)).)))))))..)))....)))))..))))))))))))(((((((..(((((((..((.(....).)).))).))))...)))))))))))))))))))))))))))))).)))..))).)))....)))))..)))....((((.(((((((......)))))..))..)))).((((..((...(((.((((((((((((.......))))))))))))..)))..)).))))))))))))..))))))).))))))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,,(({{{((((({((({{{(.,({{.,,({(((......|.|..(((((((((((((.((.......)).))))))))))))).,}|}{(({..(((((..,{,.....,|.(((((..(((((((((......(((((((((.((((...(({(,((((({{,.,,,.|.}}},..}}}....,,,{.((((((((..{(((.(((....((((.|.(((.,.((.{{....,|.{{(({((((((....)))))},,},..))).,))))....((((...(((.((((((((((((((.((.......)})))))))))...)))...)).)))))))..,.|,....))}))))))).)))))))){||||{,.{{(((((..,({{,...}.,,.)})}))))}}})})},},)))))))))))))))))))))))},))..))).}}|....||||}..}})},,,((((.{{(((((......)))))..,}..)))).{((,..,|...,,..((((((((((((.......)))))))))))).,}}...,,,))}))))))|||,,|||||},.)))))}}},))))}
Back